Att vika proteiner med Folding@home är en nobel sysselsättning bland entusiaster, där många investerar tusentals kronor i dedikerade riggar. Intresset är därför stort runt vilken hårdvara som lämpar sig allra bäst, speciellt när det kommer till moderna grafikkort.

Prestandatester har dock försvårats avsevärt av faktorer som oklara riktlinjer och att operationerna tar väldigt lång tid, där framför allt det sistnämna är en avgörande punkt. Resultatet har blivit att Folding@home i stort lyser med sin frånvaro när det kommer till större jämförelser.

Snabbtest: Prestanda i Folding@home

Nu finns det dock en lösning på problemet – officiella prestandatestet Folding@home Benchmark eller FAHBench. Programmet utför på relativt kort tid samma typer av beräkningar som vid proteinvikning, och kan därmed skilja agnarna från vetet när entusiaster jagar hårdvara till nästa supersystem.

Mjukvaran har stöd för fyra olika lägen och kan köra samtliga tester över OpenCL. Beräkningar kan hanteras explicit eller implicit, där skillnaden i korthet handlar om vilka parametrar som löpande tas hänsyn till. Förutom det kan singel- eller dubbelprecision väljas, kort och gott hur precisa tal som hanteras för flyttalsberäkningar.

Snabbtest: Prestanda i Folding@home

Vissa problem finns dock. Resultatet redovisas i smått obskyra "nanosekunder per dag", vilket är svårlänkat till traditionella Folding-måttet "Points Per Day (PPD)". Enligt användare på officiella forumet är kopplingen att varje så kallad "Work Unit" innebär delar av en simulering, vilken i sin tur representerar händelser under ett visst antal nanosekunder. Resultatet 20 ns/dag innebär alltså att 20 nanosekunder av en viss proteinvikning tar 24 timmar att beräkna.

..a WU is a part of simulation which is representing a certain amount of time. For example, a 1 000 ns simulation divided in 100 WU will make a single WU represents 10 ns. If you're folding one WU per day, you'll produce 10 ns/day ... two WU per day, 20 ns/day..

Summan av kardemumman är att ett högre värde på nanosekunder per dag innebär högre potential för proteinvikning. Värdet kan dock inte översättas rakt av till ett visst antal poäng per dag, där spelar andra faktorer in – till exempel hur komplex simuleringen är.

KomponentModell
ProcessorIntel Core i5-4670K
ModerkortMSI Z87-G45 Gaming
Minne8 GB Corsair Vengeance, 1 600 MHz, 9-9-9-24
Grafikkort
  • Gigabytes GTX 760 OC WF3X
  • Nvidia Geforce GTX Titan
  • Nvidia Geforce GTX 780
  • Nvidia Geforce GTX 770
  • Nvidia Geforce GTX 760
  • Nvidia Geforce GTX 680
  • Nvidia Geforce GTX 580
  • Nvidia Geforce GTX 480
  • AMD Radeon HD 7970 GHz
  • AMD Radeon HD 7950 Boost
  • AMD Radeon HD 7870
  • AMD Radeon HD 6970
  • AMD Radeon HD 5870
LagringSamsung 840 250 GB
NätaggregatBe Quiet Pure Power L8 630 W
SkärmAsus PB278Q
OperativsystemWindows 8 Enterprise 64-bit

Som bas används SweClockers sommardator 2013, vilken med Intel Haswell och fabriksöverklockat Geforce GTX 760 under huven innebär lagom med prestanda för de allra flesta. För att ge ytterligare kött på benen varieras grafikkortet med ytterligare tolv modeller, allt från flaggskeppet Geforce GTX Titan till mer måttliga Radeon HD 7870.

Drivrutinerna är senast tillgängliga från respektive tillverkare, vilket innebär Geforce 326.80 Beta för Nvidia samt Catalyst 13.10 beta för AMD. Observera att AMD-varianten av allt att döma visar aningen lägre prestanda jämfört med äldre versioner, dock med förbättrad stabilitet där alla deltester går igenom.

Resultat med SweClockers sommardator 2013

Först ut är en uppsjö resultat med SweClockers sommardator. Grafikkortet från Gigabyte är överklockat direkt ur kartong, och processorn testas dels i standardfrekvens, dels överklockad till 4,2 GHz för att ge extra spelrum. Inställningarna som testas är samtliga fyra alternativ mjukvaran erbjuder.

i5-4670K (3,4 GHz)i5-4670K (4,2 GHz)GB GTX 760 OC WF3X
Explicit, SP3,63 ns/dag4,16 ns/dag31,87 ns/dag
Implicit, SP3,78 ns/dag4,36 ns/dag120,28 ns/dag
Explicit, DP2,47 ns/dag2,83 ns/dag4,76 ns/dag
Implicit, DP2,33 ns/dag2,71 ns/dag6,38 ns/dag

Med de första resultaten i hand är det tydligt att proteinvikning gör sig bäst på grafikprocessorer. Trots en modern processor ur generation Haswell är sommardatorns fabriksöverklockade Geforce GTX 760 betydligt snabbare – över 30 gånger vid implicita beräkningar med singelprecision.

  • Bildspel
  • Bild 1 av 2
  • Diagram
  • Diagram
  • Bildspel
  • Bild 1 av 2

Vid singelprecision är det helt klart Nvidias Kepler-arkitektur som tar ledningen, med mäktiga Geforce Titan bekvämt parkerat i toppen. Bland AMD:s modeller hamnar föga överraskande Radeon HD 7970 GHz överst, med rejäl marginal till föregående flaggskepp Radeon HD 6970. Det har helt klart hänt en del på beräkningsfronten.

  • Bildspel
  • Bild 1 av 2
  • Diagram
  • Diagram
  • Bildspel
  • Bild 1 av 2

För dubbelprecision kastas tabellen runt ordentligt. Radeon HD 7970 GHz klättrar upp till en övertygande andraplats, endast övertrumfat av Geforce Titan i kortets speciella läge för just dubbelprecision. Intressant är också att både Geforce GTX 580 och GTX 480 klättrar förbi modernare Kepler – de sistnämnda faller rejält i tabellen med mer exakta tal att hålla reda på.

Officiella prestandatestet för Folding@home finns att ladda ned från en separat webbplats. Mjukvaran baseras på projektets senaste kärna, FAHCore 17.

Vik proteiner med Folding@home

Folding@home är ett projekt vid amerikanska Stanford University, som syftar till att använda outnyttjad datorkraft för att beräkna hur proteiner viker sig. Målet är att finna vägar hur allvarliga sjukdomar som Alzheimers uppstår och kan botas. Sammanlagt har forskarna publicerat över 100 vetenskapliga artiklar med upptäckter från beräkningsprojektet.

Snabbtest: Prestanda i Folding@home

Utöver forskning innehåller projektet även ett tävlingsmoment för att uppmana till fler deltagare. Det enda som krävs för att vara med är att installera ett litet klientprogram som kan utnyttja allt ifrån flerkärniga processorer till grafikkort och spelkonsoler för att vika proteiner. Hjälp till du med!

Instruktioner

  1. Ladda ned den officiella Folding-klienten.
  2. Installera och starta programmet
  3. Välj ett användarnamn
  4. Ange lagnummer (team number) 37451 för att gå med i SweClockers lag

Mer information om Folding@home finns i forumet.

Fotnot: Även om processen för Folding@home i normalfall körs med låg prioritet innebär den konstant hög belastning av datorsystemet. Det är därför viktigt att hålla koll på kylning och temperaturer för att undvika instabilitet.

262

Nvidia bekräftar minnesproblem i Geforce GTX 970 – begränsning i hårdvara

Det är ingen minnesbugg som upptäckts i Geforce GTX 970 utan en begränsning i hårdvaran, men Nvidia hävdar att det hela inte orsakar någon större inverkan på prestandan. Läs mer

68

Geforce GTX 970 dras med minnesbugg

Ett gäng entusiaster upptäcker att storsäljaren Geforce GTX 970 stöter på allvarliga prestandaproblem om applikationer försöker använda mer än cirka 3,3 GB videominne. Läs mer

26

Qualcomm uppges löst problem med överhettning i Snapdragon 810

Nya uppgifter talar för att Qualcomms Snapdragon 810 haft överhettningsproblem och att detta relativt nyligen korrigerats. Lösningen sägs dock innebära en försening på 2–3 månader. Läs mer

68

Acer Predator XR341CK ger ultrabred högupplöst bild med 144 Hz och G-Sync

Den blir en sällsynt kombination av finesser för gamers när Acer syr ihop en välvd ultrabred bildskärm i jätteformat med hög uppdateringsfrekvens och stöd för Nvidia G-Sync. Läs mer

29

Microsoft: "Alla universella appar kommer fungera som hologram"

En viktig byggsten för Windows 10 är ett enat ekosystem, där universella appar ska fungera med persondatorer, telefoner och Xbox One. Nu framgår att detta även ska gälla glasögonen Hololens. Läs mer

40

Nvidia Geforce GTX 960 med 4 GB videominne anländer till våren

Arkitekturen Maxwell har hittat ut i mellanklassen, men mängden videominne ställer till problem i högre upplösningar. Det här planerar Nvidia med partner att råda bot på till våren. Läs mer

102

Nvidia: Inga planer på att stödja Freesync och Displayport Adaptive-Sync

Det finns inga planer på att ge Geforce-serien stöd för dynamiska uppdateringsfrekvenser via Adaptive-Sync, men Nvidia väljer ändå att hålla dörren öppen. Läs mer

25

Apples uppdaterade Macbook Air 12 tittar fram i bilder

Vad som sägs vara det första riktiga beviset för att Apple arbetar på en större uppdatering av Macbook Air visar en högupplöst skärmpanel och förändringar av designen. Läs mer

39

Microsoft "undersöker" strömmande spel från PC till Xbox One

  • Spel
  • 2015-01-22 16:21

Kommande Windows 10 öppnar för strömmande spel från Xbox One till såväl persondatorer som plattor. Det väcker frågan om det även är aktuellt med motsatt håll. Läs mer

173

Recension: Geforce GTX 960 från Asus, Gigabyte och MSI

Arkitekturen Maxwell hittar till mellanklassen när Nvidia lanserar nya Geforce GTX 960. SweClockers testar en trio skräddarsydda grafikkort från Asus, Gigabyte och MSI. Läs mer

40

Asus Sverige-lanserar Zenbook UX305

Efter höstens tillkännagivande är Asus Zenbook UX305 på väg till svenska butikshyllor. På tapeten står två varianter, där den mest påkostade får en matt skärm 3 200 x 1 800 pixlar. Läs mer

68

Microsoft presenterar Hololens – glasögon för förstärkt verklighet

Det blir inte bara nya enheter när Microsoft introducerar Windows 10 utan även ett språng till förstärkt verklighet med hologramliknande objekt och miljöer. Läs mer

32

LG: "Qualcomm Snapdragon 810 har inga problem med överhettning i G Flex 2"

Snapdragon 810 har inga problem med överhettning. Det är LG:s svar på de rykten som cirkulerar kring Qualcomms senaste flaggskeppsprocessor, som huserar i annalkande G Flex 2. Läs mer

85

Xbox One strömmar spel till Windows 10

  • Spel
  • 2015-01-21 20:27

Med ett gemensamt operativsystem öppnas möjligheten att strömma spel från Xbox One till både persondatorer och plattor. Läs mer

Senaste nyheterna

Redaktionens senaste nyhetsrubriker

Hårdvara
Mjukvara
Övrigt
Sök jobb