Att vika proteiner med Folding@home är en nobel sysselsättning bland entusiaster, där många investerar tusentals kronor i dedikerade riggar. Intresset är därför stort runt vilken hårdvara som lämpar sig allra bäst, speciellt när det kommer till moderna grafikkort.

Prestandatester har dock försvårats avsevärt av faktorer som oklara riktlinjer och att operationerna tar väldigt lång tid, där framför allt det sistnämna är en avgörande punkt. Resultatet har blivit att Folding@home i stort lyser med sin frånvaro när det kommer till större jämförelser.

Snabbtest: Prestanda i Folding@home

Nu finns det dock en lösning på problemet – officiella prestandatestet Folding@home Benchmark eller FAHBench. Programmet utför på relativt kort tid samma typer av beräkningar som vid proteinvikning, och kan därmed skilja agnarna från vetet när entusiaster jagar hårdvara till nästa supersystem.

Mjukvaran har stöd för fyra olika lägen och kan köra samtliga tester över OpenCL. Beräkningar kan hanteras explicit eller implicit, där skillnaden i korthet handlar om vilka parametrar som löpande tas hänsyn till. Förutom det kan singel- eller dubbelprecision väljas, kort och gott hur precisa tal som hanteras för flyttalsberäkningar.

Snabbtest: Prestanda i Folding@home

Vissa problem finns dock. Resultatet redovisas i smått obskyra "nanosekunder per dag", vilket är svårlänkat till traditionella Folding-måttet "Points Per Day (PPD)". Enligt användare på officiella forumet är kopplingen att varje så kallad "Work Unit" innebär delar av en simulering, vilken i sin tur representerar händelser under ett visst antal nanosekunder. Resultatet 20 ns/dag innebär alltså att 20 nanosekunder av en viss proteinvikning tar 24 timmar att beräkna.

..a WU is a part of simulation which is representing a certain amount of time. For example, a 1 000 ns simulation divided in 100 WU will make a single WU represents 10 ns. If you're folding one WU per day, you'll produce 10 ns/day ... two WU per day, 20 ns/day..

Summan av kardemumman är att ett högre värde på nanosekunder per dag innebär högre potential för proteinvikning. Värdet kan dock inte översättas rakt av till ett visst antal poäng per dag, där spelar andra faktorer in – till exempel hur komplex simuleringen är.

KomponentModell
ProcessorIntel Core i5-4670K
ModerkortMSI Z87-G45 Gaming
Minne8 GB Corsair Vengeance, 1 600 MHz, 9-9-9-24
Grafikkort
  • Gigabytes GTX 760 OC WF3X
  • Nvidia Geforce GTX Titan
  • Nvidia Geforce GTX 780
  • Nvidia Geforce GTX 770
  • Nvidia Geforce GTX 760
  • Nvidia Geforce GTX 680
  • Nvidia Geforce GTX 580
  • Nvidia Geforce GTX 480
  • AMD Radeon HD 7970 GHz
  • AMD Radeon HD 7950 Boost
  • AMD Radeon HD 7870
  • AMD Radeon HD 6970
  • AMD Radeon HD 5870
LagringSamsung 840 250 GB
NätaggregatBe Quiet Pure Power L8 630 W
SkärmAsus PB278Q
OperativsystemWindows 8 Enterprise 64-bit

Som bas används SweClockers sommardator 2013, vilken med Intel Haswell och fabriksöverklockat Geforce GTX 760 under huven innebär lagom med prestanda för de allra flesta. För att ge ytterligare kött på benen varieras grafikkortet med ytterligare tolv modeller, allt från flaggskeppet Geforce GTX Titan till mer måttliga Radeon HD 7870.

Drivrutinerna är senast tillgängliga från respektive tillverkare, vilket innebär Geforce 326.80 Beta för Nvidia samt Catalyst 13.10 beta för AMD. Observera att AMD-varianten av allt att döma visar aningen lägre prestanda jämfört med äldre versioner, dock med förbättrad stabilitet där alla deltester går igenom.

Resultat med SweClockers sommardator 2013

Först ut är en uppsjö resultat med SweClockers sommardator. Grafikkortet från Gigabyte är överklockat direkt ur kartong, och processorn testas dels i standardfrekvens, dels överklockad till 4,2 GHz för att ge extra spelrum. Inställningarna som testas är samtliga fyra alternativ mjukvaran erbjuder.

i5-4670K (3,4 GHz)i5-4670K (4,2 GHz)GB GTX 760 OC WF3X
Explicit, SP3,63 ns/dag4,16 ns/dag31,87 ns/dag
Implicit, SP3,78 ns/dag4,36 ns/dag120,28 ns/dag
Explicit, DP2,47 ns/dag2,83 ns/dag4,76 ns/dag
Implicit, DP2,33 ns/dag2,71 ns/dag6,38 ns/dag

Med de första resultaten i hand är det tydligt att proteinvikning gör sig bäst på grafikprocessorer. Trots en modern processor ur generation Haswell är sommardatorns fabriksöverklockade Geforce GTX 760 betydligt snabbare – över 30 gånger vid implicita beräkningar med singelprecision.

  • Bildspel
  • Bild 1 av 2
  • Diagram
  • Diagram
  • Bildspel
  • Bild 1 av 2

Vid singelprecision är det helt klart Nvidias Kepler-arkitektur som tar ledningen, med mäktiga Geforce Titan bekvämt parkerat i toppen. Bland AMD:s modeller hamnar föga överraskande Radeon HD 7970 GHz överst, med rejäl marginal till föregående flaggskepp Radeon HD 6970. Det har helt klart hänt en del på beräkningsfronten.

  • Bildspel
  • Bild 1 av 2
  • Diagram
  • Diagram
  • Bildspel
  • Bild 1 av 2

För dubbelprecision kastas tabellen runt ordentligt. Radeon HD 7970 GHz klättrar upp till en övertygande andraplats, endast övertrumfat av Geforce Titan i kortets speciella läge för just dubbelprecision. Intressant är också att både Geforce GTX 580 och GTX 480 klättrar förbi modernare Kepler – de sistnämnda faller rejält i tabellen med mer exakta tal att hålla reda på.

Officiella prestandatestet för Folding@home finns att ladda ned från en separat webbplats. Mjukvaran baseras på projektets senaste kärna, FAHCore 17.

Vik proteiner med Folding@home

Folding@home är ett projekt vid amerikanska Stanford University, som syftar till att använda outnyttjad datorkraft för att beräkna hur proteiner viker sig. Målet är att finna vägar hur allvarliga sjukdomar som Alzheimers uppstår och kan botas. Sammanlagt har forskarna publicerat över 100 vetenskapliga artiklar med upptäckter från beräkningsprojektet.

Snabbtest: Prestanda i Folding@home

Utöver forskning innehåller projektet även ett tävlingsmoment för att uppmana till fler deltagare. Det enda som krävs för att vara med är att installera ett litet klientprogram som kan utnyttja allt ifrån flerkärniga processorer till grafikkort och spelkonsoler för att vika proteiner. Hjälp till du med!

Instruktioner

  1. Ladda ned den officiella Folding-klienten.
  2. Installera och starta programmet
  3. Välj ett användarnamn
  4. Ange lagnummer (team number) 37451 för att gå med i SweClockers lag

Mer information om Folding@home finns i forumet.

Fotnot: Även om processen för Folding@home i normalfall körs med låg prioritet innebär den konstant hög belastning av datorsystemet. Det är därför viktigt att hålla koll på kylning och temperaturer för att undvika instabilitet.

53

Miljontals routrar sårbara för säkerhetshålet Misfortune Cookie

Minst 12 miljoner routrar rapporteras vara sårbara för vad som kallas för Misfortune Cookie, en särskilt utformad kaka som ger fri tillgång till systemet och öppnar upp för djupare intrång i det lokala nätverk. Läs mer

33

Lian Li lanserar O-serien chassin med härdat glas och väggupphängning

Slimmade chassin med härdat glas och mångsidig orientering med väggupphängning symboliserar Lian Lis O-serie chassin, som i början av nästa år anländer i fyra olika storleksklasser. Läs mer

16

Microsoft sägs utveckla VR-glasögon till E3

Det blir mer virtuell verklighet i det nya året och inte enbart från de redan invigda. Nu sägs även Microsoft vara på väg att utmana konkurrenterna med egna glasögon. Läs mer

10

Thermalright krymper kylarna Macho och Silver Arrow för ITX-byggen

Kompakta och samtidigt kraftfulla byggen är på modet. Nu lanserar Thermalright två populära modeller i mindre utföranden, där kompatibilitet med Mini ITX-moderkort är i fokus. Läs mer

SweClockers Julkalender

  • Julkul
  • Igår 12:00

Mera ljud till huvudknoppen, skruva upp volymen och sikta mot världstoppen. I dagens kalenderlucka döljs stilfulla lurar för långa spelsessioner. Läs mer

39

Android 5.1 lanseras i början av 2015

Merparten tillverkare har ännu inte fått ut Android 5.0 till sina mobila enheter, men redan nu sägs Google förbereda nästa version. På agendan står buggfixar och polering av gränssnittet. Läs mer

23

AMD arbetar på dynamiska bildfrekvenser för lägre strömförbrukning

Grafikkortsmakaren AMD arbetar på funktionen DFRC för Radeon-serien, där användaren får kontrollen över bildfrekvenserna och därigenom kan sänka strömförbrukningen. Läs mer

55

Recension: NZXT Source S340

I den minimalistiska Source S340 skippar NZXT allt vad 5,25"-platser och iögonfallande finesser heter och tar istället sikte på en lägre prisklass. Jonas undersöker om datorlådan har vad som krävs för att möta konkurrensen. Läs mer

22

Nvidia släpper Geforce 347.09 Beta för Elite: Dangerous och Metal Gear Solid V

En ny drivrutin för grafikkorten i Geforce-serien lovar bättre prestanda för nylanserade Elite: Dangerous och kommande Metal Gear Solid V: Ground Zeroes. Läs mer

13

Silverstone förbereder SFX-L-nätaggregat med 120 mm-fläkt

För den som söker ett mindre nätaggregat och räds höga ljudnivåer gör Silverstone SX500-LG, som bygger på den djupare SFX-formfaktorn SFX-L samt huserar en 120 mm-fläkt. Läs mer

58

Saitek utvecklar spelkontroller för Farming Simulator

Glöm flygspakar och racingrattar, nästa steg för spelkontrollmakaren Saitek är en serie tillbehör för hobbylantbrukare i Farming Simulator. Läs mer

80

Rykte: Nvidia GM200 "Titan II", AMD Radeon Bermuda XT och Fiji XT i prestandatest

På kinesiska forumet Chiphell publiceras vad som sägs vara tester på flera kommande grafikkort från Nvidia och AMD, där GM200 "Titan II" såväl Bermuda XT och Fiji XT finns representerade. Läs mer

29

Nintendo kan använda Sharps Free-Form Display till kommande produkt

  • Spel
  • 2014-12-17 10:12

Sharps panelteknik Free-Form Display bryter ny mark och möjliggör närmast oändligt många former. Nu uppges Nintendo bli först att använda tekniken för en munkformad skärm. Läs mer

31

Grand Theft Auto V: Online Heists anländer i början av nästa år

  • Spel
  • 2014-12-16 17:42

I början av nästa år kopplar Rockstar Games det uppskattade spellägget Heists till internet, vilket gör det möjligt för fyra spelare att förbereda och genomföra komplexa uppdrag. Läs mer

Senaste nyheterna

Redaktionens senaste nyhetsrubriker

Hårdvara
Mjukvara
Övrigt
Skribent
Emil Åkered
Videoartiklar

Nvidia Tegra K1 med tesselering

Nvidias stora lansering för årets upplaga av CES är den mobila plattformen Tegra K1. Under mässan passar företaget på att demonstrera nykomlingens kapacitet.
Läs mer

Lian Li PC-A51

Med yttre mått som ett minitower och plats för fullstora ATX-moderkort tar Lian Lis färska aluminiumchassi PC-A51 plats i SweClockers testlabb.
Läs mer

Sök jobb