Att vika proteiner med Folding@home är en nobel sysselsättning bland entusiaster, där många investerar tusentals kronor i dedikerade riggar. Intresset är därför stort runt vilken hårdvara som lämpar sig allra bäst, speciellt när det kommer till moderna grafikkort.

Prestandatester har dock försvårats avsevärt av faktorer som oklara riktlinjer och att operationerna tar väldigt lång tid, där framför allt det sistnämna är en avgörande punkt. Resultatet har blivit att Folding@home i stort lyser med sin frånvaro när det kommer till större jämförelser.

Snabbtest: Prestanda i Folding@home

Nu finns det dock en lösning på problemet – officiella prestandatestet Folding@home Benchmark eller FAHBench. Programmet utför på relativt kort tid samma typer av beräkningar som vid proteinvikning, och kan därmed skilja agnarna från vetet när entusiaster jagar hårdvara till nästa supersystem.

Mjukvaran har stöd för fyra olika lägen och kan köra samtliga tester över OpenCL. Beräkningar kan hanteras explicit eller implicit, där skillnaden i korthet handlar om vilka parametrar som löpande tas hänsyn till. Förutom det kan singel- eller dubbelprecision väljas, kort och gott hur precisa tal som hanteras för flyttalsberäkningar.

Snabbtest: Prestanda i Folding@home

Vissa problem finns dock. Resultatet redovisas i smått obskyra "nanosekunder per dag", vilket är svårlänkat till traditionella Folding-måttet "Points Per Day (PPD)". Enligt användare på officiella forumet är kopplingen att varje så kallad "Work Unit" innebär delar av en simulering, vilken i sin tur representerar händelser under ett visst antal nanosekunder. Resultatet 20 ns/dag innebär alltså att 20 nanosekunder av en viss proteinvikning tar 24 timmar att beräkna.

..a WU is a part of simulation which is representing a certain amount of time. For example, a 1 000 ns simulation divided in 100 WU will make a single WU represents 10 ns. If you're folding one WU per day, you'll produce 10 ns/day ... two WU per day, 20 ns/day..

Summan av kardemumman är att ett högre värde på nanosekunder per dag innebär högre potential för proteinvikning. Värdet kan dock inte översättas rakt av till ett visst antal poäng per dag, där spelar andra faktorer in – till exempel hur komplex simuleringen är.

KomponentModell
ProcessorIntel Core i5-4670K
ModerkortMSI Z87-G45 Gaming
Minne8 GB Corsair Vengeance, 1 600 MHz, 9-9-9-24
Grafikkort
  • Gigabytes GTX 760 OC WF3X
  • Nvidia Geforce GTX Titan
  • Nvidia Geforce GTX 780
  • Nvidia Geforce GTX 770
  • Nvidia Geforce GTX 760
  • Nvidia Geforce GTX 680
  • Nvidia Geforce GTX 580
  • Nvidia Geforce GTX 480
  • AMD Radeon HD 7970 GHz
  • AMD Radeon HD 7950 Boost
  • AMD Radeon HD 7870
  • AMD Radeon HD 6970
  • AMD Radeon HD 5870
LagringSamsung 840 250 GB
NätaggregatBe Quiet Pure Power L8 630 W
SkärmAsus PB278Q
OperativsystemWindows 8 Enterprise 64-bit

Som bas används SweClockers sommardator 2013, vilken med Intel Haswell och fabriksöverklockat Geforce GTX 760 under huven innebär lagom med prestanda för de allra flesta. För att ge ytterligare kött på benen varieras grafikkortet med ytterligare tolv modeller, allt från flaggskeppet Geforce GTX Titan till mer måttliga Radeon HD 7870.

Drivrutinerna är senast tillgängliga från respektive tillverkare, vilket innebär Geforce 326.80 Beta för Nvidia samt Catalyst 13.10 beta för AMD. Observera att AMD-varianten av allt att döma visar aningen lägre prestanda jämfört med äldre versioner, dock med förbättrad stabilitet där alla deltester går igenom.

Resultat med SweClockers sommardator 2013

Först ut är en uppsjö resultat med SweClockers sommardator. Grafikkortet från Gigabyte är överklockat direkt ur kartong, och processorn testas dels i standardfrekvens, dels överklockad till 4,2 GHz för att ge extra spelrum. Inställningarna som testas är samtliga fyra alternativ mjukvaran erbjuder.

i5-4670K (3,4 GHz)i5-4670K (4,2 GHz)GB GTX 760 OC WF3X
Explicit, SP3,63 ns/dag4,16 ns/dag31,87 ns/dag
Implicit, SP3,78 ns/dag4,36 ns/dag120,28 ns/dag
Explicit, DP2,47 ns/dag2,83 ns/dag4,76 ns/dag
Implicit, DP2,33 ns/dag2,71 ns/dag6,38 ns/dag

Med de första resultaten i hand är det tydligt att proteinvikning gör sig bäst på grafikprocessorer. Trots en modern processor ur generation Haswell är sommardatorns fabriksöverklockade Geforce GTX 760 betydligt snabbare – över 30 gånger vid implicita beräkningar med singelprecision.

  • Bildspel
  • Bild 1 av 2
  • Diagram
  • Diagram
  • Bildspel
  • Bild 1 av 2

Vid singelprecision är det helt klart Nvidias Kepler-arkitektur som tar ledningen, med mäktiga Geforce Titan bekvämt parkerat i toppen. Bland AMD:s modeller hamnar föga överraskande Radeon HD 7970 GHz överst, med rejäl marginal till föregående flaggskepp Radeon HD 6970. Det har helt klart hänt en del på beräkningsfronten.

  • Bildspel
  • Bild 1 av 2
  • Diagram
  • Diagram
  • Bildspel
  • Bild 1 av 2

För dubbelprecision kastas tabellen runt ordentligt. Radeon HD 7970 GHz klättrar upp till en övertygande andraplats, endast övertrumfat av Geforce Titan i kortets speciella läge för just dubbelprecision. Intressant är också att både Geforce GTX 580 och GTX 480 klättrar förbi modernare Kepler – de sistnämnda faller rejält i tabellen med mer exakta tal att hålla reda på.

Officiella prestandatestet för Folding@home finns att ladda ned från en separat webbplats. Mjukvaran baseras på projektets senaste kärna, FAHCore 17.

Vik proteiner med Folding@home

Folding@home är ett projekt vid amerikanska Stanford University, som syftar till att använda outnyttjad datorkraft för att beräkna hur proteiner viker sig. Målet är att finna vägar hur allvarliga sjukdomar som Alzheimers uppstår och kan botas. Sammanlagt har forskarna publicerat över 100 vetenskapliga artiklar med upptäckter från beräkningsprojektet.

Snabbtest: Prestanda i Folding@home

Utöver forskning innehåller projektet även ett tävlingsmoment för att uppmana till fler deltagare. Det enda som krävs för att vara med är att installera ett litet klientprogram som kan utnyttja allt ifrån flerkärniga processorer till grafikkort och spelkonsoler för att vika proteiner. Hjälp till du med!

Instruktioner

  1. Ladda ned den officiella Folding-klienten.
  2. Installera och starta programmet
  3. Välj ett användarnamn
  4. Ange lagnummer (team number) 37451 för att gå med i SweClockers lag

Mer information om Folding@home finns i forumet.

Fotnot: Även om processen för Folding@home i normalfall körs med låg prioritet innebär den konstant hög belastning av datorsystemet. Det är därför viktigt att hålla koll på kylning och temperaturer för att undvika instabilitet.

5

Dell Venue 11 Pro blir fläktlös med Broadwell

Surfplattan tillika hybriden Dell Venue 11 Pro uppdateras inom kort med Intel Core M-processor, vilket medför en fläktlös design. Samtidigt väntas kompatibilitet med tidigare kringutrustning. Läs mer

13

Uppgraderingsdagar i SweClockers marknad

Passa på att städa ur gömmorna och göra plats för en och annan uppgradering. Det är gratis annonsering i SweClockers marknadsavdelning helgen ut. Läs mer

21

Corsair Hydro HG10 för Radeon R9 290-serien i november

Ett metallfäste gör det möjligt att använda slutna vattenkylningssystem från Corsair tillsammans med högpresterande grafikkort. I november släpps den första varianten. Läs mer

97

Assassin's Creed: Unity får systemkrav – minst GTX 680 eller HD 7970 rekommenderas

Ubisoft håller inte igen när systemkraven för Assassin's Creed: Unity presenteras. För att uppnå lägsta rekommenderade hårdvara krävs ett Geforce GTX 680 alternativt Radeon HD 7970. Läs mer

24

LG Sverige-lanserar G Watch R i november

Teknikentusiaster efterfrågar smarta klockor med rund och traditionsenlig design. Nu prissätts LG G Watch R, som kommer finnas på svenska butikshyllor i november. Läs mer

73

Microsoft avtäcker logotypdesign för framtida Lumia-telefoner

Den sista pusselbiten om märkningen för framtida Lumia-telefoner avslöjas och inte helt oväntat är det just "Microsoft" som kommer pryda fram- och baksida av framtida modeller. Läs mer

403

Premiär för Intel's Kitchen 2014 – världens första tv-show för datorbyggare

Tolv datorentusiaster, tre namnkunniga domare och de kända programledarna Erik och Mackan möts i datorbyggartävlingen Intel's Kitchen. Nu är det dags för premiären! Läs mer

56

Test: MSI Geforce GTX 970 Gaming

Efter lanseringen av Maxwell släpps mängder av nya grafikkort. Ett av dessa är MSI Geforce GTX 970 Gaming, som ska kombinera hög prestanda med ovanligt låg ljudnivå. Läs mer

17

Microsoft släpper adapter för Xbox One Kinect till Windows

Det blir nu möjligt att koppla in Kinect 2.0 för Xbox One till persondatorer med en ny adapter och samtidigt öppnar Microsoft upp för utvecklare att släppa Kinect-appar i Windows Store. Läs mer

50

Windows 10 får nya animationer, skrollande virtuella skrivbord

I den senaste testversionen av Windows 10 tillkommer både stora och små nyheter. Några av dessa är skrollande virtuella skrivbord och studsande fönster. Läs mer

12

Ifixit plockar isär Ipad Air 2

Hemmafixarna Ifixit plockar isär Apples nya Ipad Air 2 och bekräftar 2 GB primärminne. Samtidigt konstateras att användningen av bindemedel försvårar eventuella reparationsingrepp. Läs mer

131

Geforce Drivers 344.48 WHQL med Dynamic Super Resolution till Kepler och Fermi

Bildförbättringstekniken DSR hittar från generation Maxwell till både Kepler och Fermi när Nvidia lanserar en ny drivrutin, som dessutom är avsedd för några av höstens hetaste titlar. Läs mer

68

Jailbreak för IOS 8.1; Iphone 6 och Ipad Air 2 på ingång

Bara dagar efter lanseringen av IOS 8.1 lyckas kinesiska hackare lyfta Apples spärrar och öppna upp för icke-godkända appar, dessutom på nya Iphone 6, Ipad Air 2 och Ipad Mini 3. Läs mer

18

AMD prissänker A-serien processorer

Lagom till julhandeln sänker AMD priserna på större delen processorer i A-serien. Störst skillnad märks för toppmodellen A10-7850K, som kliver ned med 30 dollar. Läs mer

Sök jobb