Att vika proteiner med Folding@home är en nobel sysselsättning bland entusiaster, där många investerar tusentals kronor i dedikerade riggar. Intresset är därför stort runt vilken hårdvara som lämpar sig allra bäst, speciellt när det kommer till moderna grafikkort.

Prestandatester har dock försvårats avsevärt av faktorer som oklara riktlinjer och att operationerna tar väldigt lång tid, där framför allt det sistnämna är en avgörande punkt. Resultatet har blivit att Folding@home i stort lyser med sin frånvaro när det kommer till större jämförelser.

Snabbtest: Prestanda i Folding@home

Nu finns det dock en lösning på problemet – officiella prestandatestet Folding@home Benchmark eller FAHBench. Programmet utför på relativt kort tid samma typer av beräkningar som vid proteinvikning, och kan därmed skilja agnarna från vetet när entusiaster jagar hårdvara till nästa supersystem.

Mjukvaran har stöd för fyra olika lägen och kan köra samtliga tester över OpenCL. Beräkningar kan hanteras explicit eller implicit, där skillnaden i korthet handlar om vilka parametrar som löpande tas hänsyn till. Förutom det kan singel- eller dubbelprecision väljas, kort och gott hur precisa tal som hanteras för flyttalsberäkningar.

Snabbtest: Prestanda i Folding@home

Vissa problem finns dock. Resultatet redovisas i smått obskyra "nanosekunder per dag", vilket är svårlänkat till traditionella Folding-måttet "Points Per Day (PPD)". Enligt användare på officiella forumet är kopplingen att varje så kallad "Work Unit" innebär delar av en simulering, vilken i sin tur representerar händelser under ett visst antal nanosekunder. Resultatet 20 ns/dag innebär alltså att 20 nanosekunder av en viss proteinvikning tar 24 timmar att beräkna.

..a WU is a part of simulation which is representing a certain amount of time. For example, a 1 000 ns simulation divided in 100 WU will make a single WU represents 10 ns. If you're folding one WU per day, you'll produce 10 ns/day ... two WU per day, 20 ns/day..

Summan av kardemumman är att ett högre värde på nanosekunder per dag innebär högre potential för proteinvikning. Värdet kan dock inte översättas rakt av till ett visst antal poäng per dag, där spelar andra faktorer in – till exempel hur komplex simuleringen är.

KomponentModell
ProcessorIntel Core i5-4670K
ModerkortMSI Z87-G45 Gaming
Minne8 GB Corsair Vengeance, 1 600 MHz, 9-9-9-24
Grafikkort
  • Gigabytes GTX 760 OC WF3X
  • Nvidia Geforce GTX Titan
  • Nvidia Geforce GTX 780
  • Nvidia Geforce GTX 770
  • Nvidia Geforce GTX 760
  • Nvidia Geforce GTX 680
  • Nvidia Geforce GTX 580
  • Nvidia Geforce GTX 480
  • AMD Radeon HD 7970 GHz
  • AMD Radeon HD 7950 Boost
  • AMD Radeon HD 7870
  • AMD Radeon HD 6970
  • AMD Radeon HD 5870
LagringSamsung 840 250 GB
NätaggregatBe Quiet Pure Power L8 630 W
SkärmAsus PB278Q
OperativsystemWindows 8 Enterprise 64-bit

Som bas används SweClockers sommardator 2013, vilken med Intel Haswell och fabriksöverklockat Geforce GTX 760 under huven innebär lagom med prestanda för de allra flesta. För att ge ytterligare kött på benen varieras grafikkortet med ytterligare tolv modeller, allt från flaggskeppet Geforce GTX Titan till mer måttliga Radeon HD 7870.

Drivrutinerna är senast tillgängliga från respektive tillverkare, vilket innebär Geforce 326.80 Beta för Nvidia samt Catalyst 13.10 beta för AMD. Observera att AMD-varianten av allt att döma visar aningen lägre prestanda jämfört med äldre versioner, dock med förbättrad stabilitet där alla deltester går igenom.

Resultat med SweClockers sommardator 2013

Först ut är en uppsjö resultat med SweClockers sommardator. Grafikkortet från Gigabyte är överklockat direkt ur kartong, och processorn testas dels i standardfrekvens, dels överklockad till 4,2 GHz för att ge extra spelrum. Inställningarna som testas är samtliga fyra alternativ mjukvaran erbjuder.

i5-4670K (3,4 GHz)i5-4670K (4,2 GHz)GB GTX 760 OC WF3X
Explicit, SP3,63 ns/dag4,16 ns/dag31,87 ns/dag
Implicit, SP3,78 ns/dag4,36 ns/dag120,28 ns/dag
Explicit, DP2,47 ns/dag2,83 ns/dag4,76 ns/dag
Implicit, DP2,33 ns/dag2,71 ns/dag6,38 ns/dag

Med de första resultaten i hand är det tydligt att proteinvikning gör sig bäst på grafikprocessorer. Trots en modern processor ur generation Haswell är sommardatorns fabriksöverklockade Geforce GTX 760 betydligt snabbare – över 30 gånger vid implicita beräkningar med singelprecision.

  • Bildspel
  • Bild 1 av 2
  • Diagram
  • Diagram
  • Bildspel
  • Bild 1 av 2

Vid singelprecision är det helt klart Nvidias Kepler-arkitektur som tar ledningen, med mäktiga Geforce Titan bekvämt parkerat i toppen. Bland AMD:s modeller hamnar föga överraskande Radeon HD 7970 GHz överst, med rejäl marginal till föregående flaggskepp Radeon HD 6970. Det har helt klart hänt en del på beräkningsfronten.

  • Bildspel
  • Bild 1 av 2
  • Diagram
  • Diagram
  • Bildspel
  • Bild 1 av 2

För dubbelprecision kastas tabellen runt ordentligt. Radeon HD 7970 GHz klättrar upp till en övertygande andraplats, endast övertrumfat av Geforce Titan i kortets speciella läge för just dubbelprecision. Intressant är också att både Geforce GTX 580 och GTX 480 klättrar förbi modernare Kepler – de sistnämnda faller rejält i tabellen med mer exakta tal att hålla reda på.

Officiella prestandatestet för Folding@home finns att ladda ned från en separat webbplats. Mjukvaran baseras på projektets senaste kärna, FAHCore 17.

Vik proteiner med Folding@home

Folding@home är ett projekt vid amerikanska Stanford University, som syftar till att använda outnyttjad datorkraft för att beräkna hur proteiner viker sig. Målet är att finna vägar hur allvarliga sjukdomar som Alzheimers uppstår och kan botas. Sammanlagt har forskarna publicerat över 100 vetenskapliga artiklar med upptäckter från beräkningsprojektet.

Snabbtest: Prestanda i Folding@home

Utöver forskning innehåller projektet även ett tävlingsmoment för att uppmana till fler deltagare. Det enda som krävs för att vara med är att installera ett litet klientprogram som kan utnyttja allt ifrån flerkärniga processorer till grafikkort och spelkonsoler för att vika proteiner. Hjälp till du med!

Instruktioner

  1. Ladda ned den officiella Folding-klienten.
  2. Installera och starta programmet
  3. Välj ett användarnamn
  4. Ange lagnummer (team number) 37451 för att gå med i SweClockers lag

Mer information om Folding@home finns i forumet.

Fotnot: Även om processen för Folding@home i normalfall körs med låg prioritet innebär den konstant hög belastning av datorsystemet. Det är därför viktigt att hålla koll på kylning och temperaturer för att undvika instabilitet.

32

Apple bekräftar intrång i kändisars användarkonton på molntjänsten Icloud

Misstankarna om att Hollywood-kändisarnas privata bilder läckt ut från en molntjänst bekräftas av Apple, som nu medger att Icloud är källan. Ansvaret läggs dock helt och hållet på användarna. Läs mer

37

Spelmotorn Mizuchi lovar bländande grafik för den nya generationens spelmaskiner

Ett japanskt spelföretag visar upp en videosnutt från den nya spelmotorn Mizuchi, som används för att åstadkomma ray tracing-liknande bildkvalitet med imponerande detaljrikedom. Läs mer

38

AMD prissänker FX-serien och släpper nya modeller på 95 W TDP

Samtidigt som AMD introducerar Radeon R9 285 passar bolaget på att prissänka FX-serien och släppa tre nya åttakärniga processorer, varav två har 95 W TDP. Läs mer

37

AMD lanserar Radeon R9 285 "Tonga Pro"

Idag lanserar AMD Radeon R9 285 med grafikprocessorn Tonga, som är en direkt ersättare till Radeon R9 280. Detta ackompanjeras av spelkampanjen Never Settle: Space Edition. Läs mer

38

Nvidia firar in Geforce GTX 900-serien med direktsända Game24

Under hela 24 timmar ska Nvidia slå ett slag för PC-spelsvärlden i ett evenemang som direktsänds på nätet. I samband med detta lanseras de första grafikkorten i den nya Geforce GTX 900-serien. Läs mer

67

Microsoft bekräftar Windows 9 av misstag

Nästa stora version av Windows är i antågande och trots att en första testversion ligger nära i tiden saknas ett officiellt namn. Nu bekräftas Windows 9 av Microsoft på sociala medier. Läs mer

59

Xbox One Sverige-lanseras utan stöd för svenska röstkommandon

I slutet av veckan lanseras Xbox One officiellt i ytterligare 26 länder, däribland Sverige. Nu framgår att språkstöd för en av spelkonsolens huvudfinesser till en början uteblir. Läs mer

63

Apple Find My Iphone kan ha orsakat stulna kändisbilder

Ett säkerhetsproblem i Find My Iphone misstänks ha öppnat upp för de angrepp som resulterade i att hundratals privata bilder från Hollywood-kändisar läckte ut på nätet. Läs mer

168

Stulna nakenbilder på kändisar väcker frågor om säkerheten i molnet

En mängd filmstjärnor och andra celebriteter har fått sina privata bilder stulna i vad som ser ut att vara ett större angrepp mot en eller flera molntjänster. Läs mer

13

MSI visar grafikkylaren Twin Frozr V för Geforce GTX 980 och 970

Grafikkretsen GM204 från Nvidia är i antågande och för detta förbereder MSI femte generationens Twin Frozr-kylare, som komponentjätten nu publicerar en rendering av. Läs mer

48

Alienware återupplivar värstingserien Area 51 för spel i 4K-upplösning

För entusiaster och gamers på jakt efter det extrema återupplivar Alienware modellserien Area 51 med en iögonfallande triangeldesign och ytterst påkostade komponenter. Läs mer

48

Dell introducerar böjda UltraSharp U3415W

Större, bredare och framförallt med iögonfallande kurvatur. Dell introducerar en ny ultrabred skärm i familjen Ultrasharp, som ska passa lika bra för gaming som för skrivbordsarbete. Läs mer

37

Video: Prisade digitaleffekter från Game of Thrones

Fantasyserien Game of Thrones kammar utmärkelser under Emmy-galan. En av vinnarna är effektmakarna Rodeo, vilka visar upp delar av arbetet. Läs mer

179

Intel Core i7-5960X, i7-5930K och i7-5820K – familjen Haswell-E

Entusiaster och överklockare kan se fram emot en hel del när Intel lanserar den nya Core i7-5000-serien. Nu är det dags att undersöka vad den ytterst påkostade plattformen har att erbjuda. Läs mer

Senaste nyheterna

Redaktionens senaste nyhetsrubriker

Hårdvara
Mjukvara
Övrigt
Sök jobb