Att vika proteiner med Folding@home är en nobel sysselsättning bland entusiaster, där många investerar tusentals kronor i dedikerade riggar. Intresset är därför stort runt vilken hårdvara som lämpar sig allra bäst, speciellt när det kommer till moderna grafikkort.

Prestandatester har dock försvårats avsevärt av faktorer som oklara riktlinjer och att operationerna tar väldigt lång tid, där framför allt det sistnämna är en avgörande punkt. Resultatet har blivit att Folding@home i stort lyser med sin frånvaro när det kommer till större jämförelser.

Snabbtest: Prestanda i Folding@home

Nu finns det dock en lösning på problemet – officiella prestandatestet Folding@home Benchmark eller FAHBench. Programmet utför på relativt kort tid samma typer av beräkningar som vid proteinvikning, och kan därmed skilja agnarna från vetet när entusiaster jagar hårdvara till nästa supersystem.

Mjukvaran har stöd för fyra olika lägen och kan köra samtliga tester över OpenCL. Beräkningar kan hanteras explicit eller implicit, där skillnaden i korthet handlar om vilka parametrar som löpande tas hänsyn till. Förutom det kan singel- eller dubbelprecision väljas, kort och gott hur precisa tal som hanteras för flyttalsberäkningar.

Snabbtest: Prestanda i Folding@home

Vissa problem finns dock. Resultatet redovisas i smått obskyra "nanosekunder per dag", vilket är svårlänkat till traditionella Folding-måttet "Points Per Day (PPD)". Enligt användare på officiella forumet är kopplingen att varje så kallad "Work Unit" innebär delar av en simulering, vilken i sin tur representerar händelser under ett visst antal nanosekunder. Resultatet 20 ns/dag innebär alltså att 20 nanosekunder av en viss proteinvikning tar 24 timmar att beräkna.

..a WU is a part of simulation which is representing a certain amount of time. For example, a 1 000 ns simulation divided in 100 WU will make a single WU represents 10 ns. If you're folding one WU per day, you'll produce 10 ns/day ... two WU per day, 20 ns/day..

Summan av kardemumman är att ett högre värde på nanosekunder per dag innebär högre potential för proteinvikning. Värdet kan dock inte översättas rakt av till ett visst antal poäng per dag, där spelar andra faktorer in – till exempel hur komplex simuleringen är.

KomponentModell
ProcessorIntel Core i5-4670K
ModerkortMSI Z87-G45 Gaming
Minne8 GB Corsair Vengeance, 1 600 MHz, 9-9-9-24
Grafikkort
  • Gigabytes GTX 760 OC WF3X
  • Nvidia Geforce GTX Titan
  • Nvidia Geforce GTX 780
  • Nvidia Geforce GTX 770
  • Nvidia Geforce GTX 760
  • Nvidia Geforce GTX 680
  • Nvidia Geforce GTX 580
  • Nvidia Geforce GTX 480
  • AMD Radeon HD 7970 GHz
  • AMD Radeon HD 7950 Boost
  • AMD Radeon HD 7870
  • AMD Radeon HD 6970
  • AMD Radeon HD 5870
LagringSamsung 840 250 GB
NätaggregatBe Quiet Pure Power L8 630 W
SkärmAsus PB278Q
OperativsystemWindows 8 Enterprise 64-bit

Som bas används SweClockers sommardator 2013, vilken med Intel Haswell och fabriksöverklockat Geforce GTX 760 under huven innebär lagom med prestanda för de allra flesta. För att ge ytterligare kött på benen varieras grafikkortet med ytterligare tolv modeller, allt från flaggskeppet Geforce GTX Titan till mer måttliga Radeon HD 7870.

Drivrutinerna är senast tillgängliga från respektive tillverkare, vilket innebär Geforce 326.80 Beta för Nvidia samt Catalyst 13.10 beta för AMD. Observera att AMD-varianten av allt att döma visar aningen lägre prestanda jämfört med äldre versioner, dock med förbättrad stabilitet där alla deltester går igenom.

Resultat med SweClockers sommardator 2013

Först ut är en uppsjö resultat med SweClockers sommardator. Grafikkortet från Gigabyte är överklockat direkt ur kartong, och processorn testas dels i standardfrekvens, dels överklockad till 4,2 GHz för att ge extra spelrum. Inställningarna som testas är samtliga fyra alternativ mjukvaran erbjuder.

i5-4670K (3,4 GHz)i5-4670K (4,2 GHz)GB GTX 760 OC WF3X
Explicit, SP3,63 ns/dag4,16 ns/dag31,87 ns/dag
Implicit, SP3,78 ns/dag4,36 ns/dag120,28 ns/dag
Explicit, DP2,47 ns/dag2,83 ns/dag4,76 ns/dag
Implicit, DP2,33 ns/dag2,71 ns/dag6,38 ns/dag

Med de första resultaten i hand är det tydligt att proteinvikning gör sig bäst på grafikprocessorer. Trots en modern processor ur generation Haswell är sommardatorns fabriksöverklockade Geforce GTX 760 betydligt snabbare – över 30 gånger vid implicita beräkningar med singelprecision.

  • Bildspel
  • Bild 1 av 2
  • Diagram
  • Diagram
  • Bildspel
  • Bild 1 av 2

Vid singelprecision är det helt klart Nvidias Kepler-arkitektur som tar ledningen, med mäktiga Geforce Titan bekvämt parkerat i toppen. Bland AMD:s modeller hamnar föga överraskande Radeon HD 7970 GHz överst, med rejäl marginal till föregående flaggskepp Radeon HD 6970. Det har helt klart hänt en del på beräkningsfronten.

  • Bildspel
  • Bild 1 av 2
  • Diagram
  • Diagram
  • Bildspel
  • Bild 1 av 2

För dubbelprecision kastas tabellen runt ordentligt. Radeon HD 7970 GHz klättrar upp till en övertygande andraplats, endast övertrumfat av Geforce Titan i kortets speciella läge för just dubbelprecision. Intressant är också att både Geforce GTX 580 och GTX 480 klättrar förbi modernare Kepler – de sistnämnda faller rejält i tabellen med mer exakta tal att hålla reda på.

Officiella prestandatestet för Folding@home finns att ladda ned från en separat webbplats. Mjukvaran baseras på projektets senaste kärna, FAHCore 17.

Vik proteiner med Folding@home

Folding@home är ett projekt vid amerikanska Stanford University, som syftar till att använda outnyttjad datorkraft för att beräkna hur proteiner viker sig. Målet är att finna vägar hur allvarliga sjukdomar som Alzheimers uppstår och kan botas. Sammanlagt har forskarna publicerat över 100 vetenskapliga artiklar med upptäckter från beräkningsprojektet.

Snabbtest: Prestanda i Folding@home

Utöver forskning innehåller projektet även ett tävlingsmoment för att uppmana till fler deltagare. Det enda som krävs för att vara med är att installera ett litet klientprogram som kan utnyttja allt ifrån flerkärniga processorer till grafikkort och spelkonsoler för att vika proteiner. Hjälp till du med!

Instruktioner

  1. Ladda ned den officiella Folding-klienten.
  2. Installera och starta programmet
  3. Välj ett användarnamn
  4. Ange lagnummer (team number) 37451 för att gå med i SweClockers lag

Mer information om Folding@home finns i forumet.

Fotnot: Även om processen för Folding@home i normalfall körs med låg prioritet innebär den konstant hög belastning av datorsystemet. Det är därför viktigt att hålla koll på kylning och temperaturer för att undvika instabilitet.

11

Swiftech H240-X är expanderbar vätskekylare med 280 mm-radiator

Färdigmonterade vattenkylare med möjlighet till expansion växer i antal. Nu utökar Swiftech utbudet med H240-X, där nyheten från H220-X är att radiatorn kliver upp till 280 millimeter. Läs mer

68

Windows 10 i skärmdumpar och bilder

Den som är nyfiken på Microsofts kommande operativsystem får en förhandstitt i Windows 10 Technical Preview, som bland annat levererar en pånyttfödd startmeny och virtuella skrivbord. Läs mer

30

Google Nexus 6 med 5,92-tumsskärm i bilder

Inför den annalkande lanseringen läckor bilder ut på vad som uppges vara Nexus 6, som tack vare tunna skärmramar kan bli mindre än väntat. Läs mer

84

DirectX 12 lanseras med Windows 10

Microsoft bekräftar att DirectX 12 kommer lanseras tillsammans med Windows 10 senare under 2015, men ger ännu inte några besked om kompatibilitet med äldre operativsystem. Läs mer

107

Microsoft startar Windows 10 Technical Preview

Den som är nyfiken på Windows 10 kan ladda ned och installera testversionen Technical Preview. Läs mer

30

Recension: Antec Edge 750 W

Välrenommerade Seasonic lägger grunden till nya Antec Edge 750 W, som tar plats i SweClockers testlabb med löften om hög verkningsgrad och låg ljudnivå. Läs mer

100

Tävla och vinn gamingpaket med Func

  • Tävling
  • Igår 15:10

De svenska gamingspecialisterna på Func efterlyser klassisk Göteborgshumor i en ny tävling för medlemmarna, där tre fullspäckade gamingpaket väntar på prispallen. Läs mer

35

Securedrives gör SSD-enhet med kryptering och självförstörelsefunktion

Brittiska Securedrives gör en SSD-enhet som förutom kryptering och andra säkerhetsfinesser även kan förstöra enhetens NAND-lagringskretsar med ett enkelt SMS. Läs mer

21

Asus öppnar svensk tillbehörsbutik

Den som vill ha officiella tillbehör och kringutrustning från Asus kan nu införskaffa dessa i bolagets officiella webbutik, som slår upp portarna för svenska, danska och finska konsumenter. Läs mer

25

Deepcool släpper vattenkylarna Captain

Två iögonfallande vattenkylningssystem är senast ut från Deepcool, som nu presenterar serien Captain med utanpåliggande rör. Läs mer

24

Asus avtäcker NUC-liknande Vivomini

Komponentjätten Asus ger sig in i leken om kompakta stationära datorer med Vivomini, där några av huvudnumren är inkluderat trådlöst nätverk 802.11ac och VESA-fäste. Läs mer

247

Microsoft tillkännager Windows 10

Nästa version av Windows blir inte nummer nio utan förvandlas till Windows 10. Samtidigt presenteras en storsatsning på ett gemensamt ekosystem för samtliga typer av enheter. Läs mer

147

Microsofts presenterar Windows 9 under kvällskvisten

Framtiden för operativsystemet Windows är temat när Microsoft öppnar dörrarna till kvällens presskonferens i San Francisco. I centrum står vad som hittills är känt som Windows 9. Läs mer

33

Asus Zenbook UX305 med passivt kyld Broadwell prissätts

En av de stora snackisarna på årets IFA-mässa var Intels arkitektur Broadwell med tillhörande designvinster och nu hittar instegspriset ut för den kanske hittills mest omtalade. Läs mer

Sök jobb