Att vika proteiner med Folding@home är en nobel sysselsättning bland entusiaster, där många investerar tusentals kronor i dedikerade riggar. Intresset är därför stort runt vilken hårdvara som lämpar sig allra bäst, speciellt när det kommer till moderna grafikkort.

Prestandatester har dock försvårats avsevärt av faktorer som oklara riktlinjer och att operationerna tar väldigt lång tid, där framför allt det sistnämna är en avgörande punkt. Resultatet har blivit att Folding@home i stort lyser med sin frånvaro när det kommer till större jämförelser.

Snabbtest: Prestanda i Folding@home

Nu finns det dock en lösning på problemet – officiella prestandatestet Folding@home Benchmark eller FAHBench. Programmet utför på relativt kort tid samma typer av beräkningar som vid proteinvikning, och kan därmed skilja agnarna från vetet när entusiaster jagar hårdvara till nästa supersystem.

Mjukvaran har stöd för fyra olika lägen och kan köra samtliga tester över OpenCL. Beräkningar kan hanteras explicit eller implicit, där skillnaden i korthet handlar om vilka parametrar som löpande tas hänsyn till. Förutom det kan singel- eller dubbelprecision väljas, kort och gott hur precisa tal som hanteras för flyttalsberäkningar.

Snabbtest: Prestanda i Folding@home

Vissa problem finns dock. Resultatet redovisas i smått obskyra "nanosekunder per dag", vilket är svårlänkat till traditionella Folding-måttet "Points Per Day (PPD)". Enligt användare på officiella forumet är kopplingen att varje så kallad "Work Unit" innebär delar av en simulering, vilken i sin tur representerar händelser under ett visst antal nanosekunder. Resultatet 20 ns/dag innebär alltså att 20 nanosekunder av en viss proteinvikning tar 24 timmar att beräkna.

..a WU is a part of simulation which is representing a certain amount of time. For example, a 1 000 ns simulation divided in 100 WU will make a single WU represents 10 ns. If you're folding one WU per day, you'll produce 10 ns/day ... two WU per day, 20 ns/day..

Summan av kardemumman är att ett högre värde på nanosekunder per dag innebär högre potential för proteinvikning. Värdet kan dock inte översättas rakt av till ett visst antal poäng per dag, där spelar andra faktorer in – till exempel hur komplex simuleringen är.

KomponentModell
ProcessorIntel Core i5-4670K
ModerkortMSI Z87-G45 Gaming
Minne8 GB Corsair Vengeance, 1 600 MHz, 9-9-9-24
Grafikkort
  • Gigabytes GTX 760 OC WF3X
  • Nvidia Geforce GTX Titan
  • Nvidia Geforce GTX 780
  • Nvidia Geforce GTX 770
  • Nvidia Geforce GTX 760
  • Nvidia Geforce GTX 680
  • Nvidia Geforce GTX 580
  • Nvidia Geforce GTX 480
  • AMD Radeon HD 7970 GHz
  • AMD Radeon HD 7950 Boost
  • AMD Radeon HD 7870
  • AMD Radeon HD 6970
  • AMD Radeon HD 5870
LagringSamsung 840 250 GB
NätaggregatBe Quiet Pure Power L8 630 W
SkärmAsus PB278Q
OperativsystemWindows 8 Enterprise 64-bit

Som bas används SweClockers sommardator 2013, vilken med Intel Haswell och fabriksöverklockat Geforce GTX 760 under huven innebär lagom med prestanda för de allra flesta. För att ge ytterligare kött på benen varieras grafikkortet med ytterligare tolv modeller, allt från flaggskeppet Geforce GTX Titan till mer måttliga Radeon HD 7870.

Drivrutinerna är senast tillgängliga från respektive tillverkare, vilket innebär Geforce 326.80 Beta för Nvidia samt Catalyst 13.10 beta för AMD. Observera att AMD-varianten av allt att döma visar aningen lägre prestanda jämfört med äldre versioner, dock med förbättrad stabilitet där alla deltester går igenom.

Resultat med SweClockers sommardator 2013

Först ut är en uppsjö resultat med SweClockers sommardator. Grafikkortet från Gigabyte är överklockat direkt ur kartong, och processorn testas dels i standardfrekvens, dels överklockad till 4,2 GHz för att ge extra spelrum. Inställningarna som testas är samtliga fyra alternativ mjukvaran erbjuder.

i5-4670K (3,4 GHz)i5-4670K (4,2 GHz)GB GTX 760 OC WF3X
Explicit, SP3,63 ns/dag4,16 ns/dag31,87 ns/dag
Implicit, SP3,78 ns/dag4,36 ns/dag120,28 ns/dag
Explicit, DP2,47 ns/dag2,83 ns/dag4,76 ns/dag
Implicit, DP2,33 ns/dag2,71 ns/dag6,38 ns/dag

Med de första resultaten i hand är det tydligt att proteinvikning gör sig bäst på grafikprocessorer. Trots en modern processor ur generation Haswell är sommardatorns fabriksöverklockade Geforce GTX 760 betydligt snabbare – över 30 gånger vid implicita beräkningar med singelprecision.

  • Bildspel
  • Bild 1 av 2
  • Diagram
  • Diagram
  • Bildspel
  • Bild 1 av 2

Vid singelprecision är det helt klart Nvidias Kepler-arkitektur som tar ledningen, med mäktiga Geforce Titan bekvämt parkerat i toppen. Bland AMD:s modeller hamnar föga överraskande Radeon HD 7970 GHz överst, med rejäl marginal till föregående flaggskepp Radeon HD 6970. Det har helt klart hänt en del på beräkningsfronten.

  • Bildspel
  • Bild 1 av 2
  • Diagram
  • Diagram
  • Bildspel
  • Bild 1 av 2

För dubbelprecision kastas tabellen runt ordentligt. Radeon HD 7970 GHz klättrar upp till en övertygande andraplats, endast övertrumfat av Geforce Titan i kortets speciella läge för just dubbelprecision. Intressant är också att både Geforce GTX 580 och GTX 480 klättrar förbi modernare Kepler – de sistnämnda faller rejält i tabellen med mer exakta tal att hålla reda på.

Officiella prestandatestet för Folding@home finns att ladda ned från en separat webbplats. Mjukvaran baseras på projektets senaste kärna, FAHCore 17.

Vik proteiner med Folding@home

Folding@home är ett projekt vid amerikanska Stanford University, som syftar till att använda outnyttjad datorkraft för att beräkna hur proteiner viker sig. Målet är att finna vägar hur allvarliga sjukdomar som Alzheimers uppstår och kan botas. Sammanlagt har forskarna publicerat över 100 vetenskapliga artiklar med upptäckter från beräkningsprojektet.

Snabbtest: Prestanda i Folding@home

Utöver forskning innehåller projektet även ett tävlingsmoment för att uppmana till fler deltagare. Det enda som krävs för att vara med är att installera ett litet klientprogram som kan utnyttja allt ifrån flerkärniga processorer till grafikkort och spelkonsoler för att vika proteiner. Hjälp till du med!

Instruktioner

  1. Ladda ned den officiella Folding-klienten.
  2. Installera och starta programmet
  3. Välj ett användarnamn
  4. Ange lagnummer (team number) 37451 för att gå med i SweClockers lag

Mer information om Folding@home finns i forumet.

Fotnot: Även om processen för Folding@home i normalfall körs med låg prioritet innebär den konstant hög belastning av datorsystemet. Det är därför viktigt att hålla koll på kylning och temperaturer för att undvika instabilitet.

36

Asus tillkännager RT-AC87U – först ut med Quantenna 802.11ac

Skyhög nätverksprestanda är löftet när Asus presenterar den nya trådlösa routern RT-AC87U, som är först ut med Quantennas omtalade 802.11ac-krets. Läs mer

29

AOC lanserar ultrabreda U3477PQU med 3 440 x 1 440 pixlar

Intresset för skärmar med bildförhållandet 21:9 är på fortsatt uppgång och en av modellerna i antågande är 34-tummaren AOC U3477PQU, som nu är på väg till svenska återförsäljare. Läs mer

53

HP Stream 14 är Chromebook-utmanare för under 2 000 kronor

Till julhandeln planerar Microsoft att ta upp kampen mot Google Chromebook. Nu läcker detaljerna ut för vad som sägs vara en prispressad HP-dator för endast 199 dollar. Läs mer

92

Digital speldistribution utgör 92 procent av PC-spelsmarknaden

Spel på skivor kan snart vara ett minne blott. Enligt en brittisk analysfirma sker mindre än tio procent av spelförsäljningen för PC-plattformen i fysiska butiker. Läs mer

44

Sharp Aquos Crystal är mobiltelefoner med trimmade skärmramar

Tunnare skärmramar är vida efterfrågat bland entusiaster och just detta är huvudnumret med Sharps senaste smarta telefoner Aquos Crystal samt Aquos Crystal X. Läs mer

46

AMD lanserar Radeon R7 SSD

Varumärket Radeon får tillökning i form av SSD-enheter. Det handlar om OCZ-tillverkade modeller, som AMD hävdar ska erbjuda överlägsen hållbarhet i kombination med prestanda i klassen. Läs mer

75

Recension: Noctua NH-D15

Det blir ett tronskifte i sortimentet när den populära Noctua NH-D14 följs upp av den nya bjässen NH-D15. Häng med när SweClockers testar en processorkylare utöver det vanliga. Läs mer

41

Asus ROG Swift drabbas av panelbrist

Många vill lägga vantarna på den lyxiga gamingskärmen Asus ROG Swift PG278Q, men efter de inledande leveranserna gapar butikshyllorna tomma. Orsaken är brist på skärmpaneler. Läs mer

79

Intel Core i7-5960X "Haswell-E" butikslistas

Inför den stundande lanseringen av Intel Core i7-5000-serien butikslistas det nya flaggskeppet, som i dagsläget ligger ett antal tusenlappar över den nuvarande toppmodellen Core i7-4960X. Läs mer

57

LG gör böjd ultrabred 34-tummare med IPS-panel

Det blir flera skärmnyheter från LG på mässan IFA i september, däribland en ultrabred modell med IPS-panel samt en högupplöst skärm i filmformatet 4K Digital Cinema. Läs mer

58

AMD prissänker FX-9590 och lanserar nya processorer i september

Till hösten planerar AMD prissänkningar för flaggskeppet FX-9590 och som storsäljaren FX-6300, vilket ska ackompanjeras av tre nya åttakärniga processormodeller för sockel AM3+. Läs mer

57

Windows Threshold i testversion till hösten

Den som ser fram emot nästa stora version av Windows behöver inte vänta länge. Så tidigt som slutet av september kan den första publika testversionen hitta ut. Läs mer

70

SweClockers provkör Oculus Rift DK2

Virtuell verklighet är i ropet och främst i ledet står Oculus med den andra utvecklingsversionen av glasögonen Rift. Emil och Jonas delar med sig av erfarenheterna från första veckans testande. Läs mer

40

Asrock avslöjar X99M Killer – Micro ATX för Intel Haswell-E

Inför lanseringen av Core i7-5000-serien presenterar Asrock ett moderkort enligt formfaktorn Micro ATX, vars finesser är närmast identiska med den nyligen tillkännagivna ATX-varianten. Läs mer

Senaste nyheterna

Redaktionens senaste nyhetsrubriker

Hårdvara
Mjukvara
Övrigt
Sök jobb