Att vika proteiner med Folding@home är en nobel sysselsättning bland entusiaster, där många investerar tusentals kronor i dedikerade riggar. Intresset är därför stort runt vilken hårdvara som lämpar sig allra bäst, speciellt när det kommer till moderna grafikkort.

Prestandatester har dock försvårats avsevärt av faktorer som oklara riktlinjer och att operationerna tar väldigt lång tid, där framför allt det sistnämna är en avgörande punkt. Resultatet har blivit att Folding@home i stort lyser med sin frånvaro när det kommer till större jämförelser.

Snabbtest: Prestanda i Folding@home

Nu finns det dock en lösning på problemet – officiella prestandatestet Folding@home Benchmark eller FAHBench. Programmet utför på relativt kort tid samma typer av beräkningar som vid proteinvikning, och kan därmed skilja agnarna från vetet när entusiaster jagar hårdvara till nästa supersystem.

Mjukvaran har stöd för fyra olika lägen och kan köra samtliga tester över OpenCL. Beräkningar kan hanteras explicit eller implicit, där skillnaden i korthet handlar om vilka parametrar som löpande tas hänsyn till. Förutom det kan singel- eller dubbelprecision väljas, kort och gott hur precisa tal som hanteras för flyttalsberäkningar.

Snabbtest: Prestanda i Folding@home

Vissa problem finns dock. Resultatet redovisas i smått obskyra "nanosekunder per dag", vilket är svårlänkat till traditionella Folding-måttet "Points Per Day (PPD)". Enligt användare på officiella forumet är kopplingen att varje så kallad "Work Unit" innebär delar av en simulering, vilken i sin tur representerar händelser under ett visst antal nanosekunder. Resultatet 20 ns/dag innebär alltså att 20 nanosekunder av en viss proteinvikning tar 24 timmar att beräkna.

..a WU is a part of simulation which is representing a certain amount of time. For example, a 1 000 ns simulation divided in 100 WU will make a single WU represents 10 ns. If you're folding one WU per day, you'll produce 10 ns/day ... two WU per day, 20 ns/day..

Summan av kardemumman är att ett högre värde på nanosekunder per dag innebär högre potential för proteinvikning. Värdet kan dock inte översättas rakt av till ett visst antal poäng per dag, där spelar andra faktorer in – till exempel hur komplex simuleringen är.

KomponentModell
ProcessorIntel Core i5-4670K
ModerkortMSI Z87-G45 Gaming
Minne8 GB Corsair Vengeance, 1 600 MHz, 9-9-9-24
Grafikkort
  • Gigabytes GTX 760 OC WF3X
  • Nvidia Geforce GTX Titan
  • Nvidia Geforce GTX 780
  • Nvidia Geforce GTX 770
  • Nvidia Geforce GTX 760
  • Nvidia Geforce GTX 680
  • Nvidia Geforce GTX 580
  • Nvidia Geforce GTX 480
  • AMD Radeon HD 7970 GHz
  • AMD Radeon HD 7950 Boost
  • AMD Radeon HD 7870
  • AMD Radeon HD 6970
  • AMD Radeon HD 5870
LagringSamsung 840 250 GB
NätaggregatBe Quiet Pure Power L8 630 W
SkärmAsus PB278Q
OperativsystemWindows 8 Enterprise 64-bit

Som bas används SweClockers sommardator 2013, vilken med Intel Haswell och fabriksöverklockat Geforce GTX 760 under huven innebär lagom med prestanda för de allra flesta. För att ge ytterligare kött på benen varieras grafikkortet med ytterligare tolv modeller, allt från flaggskeppet Geforce GTX Titan till mer måttliga Radeon HD 7870.

Drivrutinerna är senast tillgängliga från respektive tillverkare, vilket innebär Geforce 326.80 Beta för Nvidia samt Catalyst 13.10 beta för AMD. Observera att AMD-varianten av allt att döma visar aningen lägre prestanda jämfört med äldre versioner, dock med förbättrad stabilitet där alla deltester går igenom.

Resultat med SweClockers sommardator 2013

Först ut är en uppsjö resultat med SweClockers sommardator. Grafikkortet från Gigabyte är överklockat direkt ur kartong, och processorn testas dels i standardfrekvens, dels överklockad till 4,2 GHz för att ge extra spelrum. Inställningarna som testas är samtliga fyra alternativ mjukvaran erbjuder.

i5-4670K (3,4 GHz)i5-4670K (4,2 GHz)GB GTX 760 OC WF3X
Explicit, SP3,63 ns/dag4,16 ns/dag31,87 ns/dag
Implicit, SP3,78 ns/dag4,36 ns/dag120,28 ns/dag
Explicit, DP2,47 ns/dag2,83 ns/dag4,76 ns/dag
Implicit, DP2,33 ns/dag2,71 ns/dag6,38 ns/dag

Med de första resultaten i hand är det tydligt att proteinvikning gör sig bäst på grafikprocessorer. Trots en modern processor ur generation Haswell är sommardatorns fabriksöverklockade Geforce GTX 760 betydligt snabbare – över 30 gånger vid implicita beräkningar med singelprecision.

  • Bildspel
  • Bild 1 av 2
  • Diagram
  • Diagram
  • Bildspel
  • Bild 1 av 2

Vid singelprecision är det helt klart Nvidias Kepler-arkitektur som tar ledningen, med mäktiga Geforce Titan bekvämt parkerat i toppen. Bland AMD:s modeller hamnar föga överraskande Radeon HD 7970 GHz överst, med rejäl marginal till föregående flaggskepp Radeon HD 6970. Det har helt klart hänt en del på beräkningsfronten.

  • Bildspel
  • Bild 1 av 2
  • Diagram
  • Diagram
  • Bildspel
  • Bild 1 av 2

För dubbelprecision kastas tabellen runt ordentligt. Radeon HD 7970 GHz klättrar upp till en övertygande andraplats, endast övertrumfat av Geforce Titan i kortets speciella läge för just dubbelprecision. Intressant är också att både Geforce GTX 580 och GTX 480 klättrar förbi modernare Kepler – de sistnämnda faller rejält i tabellen med mer exakta tal att hålla reda på.

Officiella prestandatestet för Folding@home finns att ladda ned från en separat webbplats. Mjukvaran baseras på projektets senaste kärna, FAHCore 17.

Vik proteiner med Folding@home

Folding@home är ett projekt vid amerikanska Stanford University, som syftar till att använda outnyttjad datorkraft för att beräkna hur proteiner viker sig. Målet är att finna vägar hur allvarliga sjukdomar som Alzheimers uppstår och kan botas. Sammanlagt har forskarna publicerat över 100 vetenskapliga artiklar med upptäckter från beräkningsprojektet.

Snabbtest: Prestanda i Folding@home

Utöver forskning innehåller projektet även ett tävlingsmoment för att uppmana till fler deltagare. Det enda som krävs för att vara med är att installera ett litet klientprogram som kan utnyttja allt ifrån flerkärniga processorer till grafikkort och spelkonsoler för att vika proteiner. Hjälp till du med!

Instruktioner

  1. Ladda ned den officiella Folding-klienten.
  2. Installera och starta programmet
  3. Välj ett användarnamn
  4. Ange lagnummer (team number) 37451 för att gå med i SweClockers lag

Mer information om Folding@home finns i forumet.

Fotnot: Även om processen för Folding@home i normalfall körs med låg prioritet innebär den konstant hög belastning av datorsystemet. Det är därför viktigt att hålla koll på kylning och temperaturer för att undvika instabilitet.

29

Tävla och vinn nätdelar från Seasonic

  • Tävling
  • Igår 16:43

Välrenommerade Seasonic drar igång en ny tävling för SweClockers medlemmar. I prispotten väntar tre påkostade och fullt modulära nätaggregat med 80 Plus Platinum-klassning. Läs mer

51

Bredbandsbolaget täpper till säkerhetshål och låser ned berörda Zyxel-modem

Internetleverantören Bredbandsbolaget täpper till säkerhetsbristen som potentiellt kunde drabba över 100 000 hushåll och låser samtidigt administratörsgränssnitten till de berörda modemen. Läs mer

52

Nvidia öppnar för Geforce GTX 980 med 8 GB videominne innan årsskiftet

Den som vill spela i höga upplösningar får ett nytt alternativ när Geforce GTX 980 utrustas med 8 GB videominne. Samtidigt talas det om att 900-serien är på väg att utökas. Läs mer

16

Lenovo släpper Yoga Tablet 2 på 13 tum med QHD-upplösning och Windows

Surfplatteserien Yoga Tablet 2 utökas med ännu en Windows-variant, som får en högupplöst 13,3-tumsskärm, inkluderat tangentbord och Intel Atom-processor med 4 GB primärminne. Läs mer

59

Nvidia visar Geforce-specifika effekter i Assassin's Creed Unity

Den franska revolutionen blir mer detaljrik på PC-plattformen tack vare högre upplösning och förbättrade texturer, men även en uppsjö Geforce-specifika tekniker. Läs mer

38

Nvidia Geforce Titan Z säljs till halva priset

Prissänkningen av GTX Titan Z har börjat få effekt i svenska butiker, men ytterligare något lägre priser är att vänta. Samtidigt pekar mycket mot att grafikkortet håller på att fasas ut. Läs mer

40

Microsoft Band är smart träningsarmband för Windows Phone, Android och IOS

När Microsoft ger sig in i matchen för smarta klockor är det med träningsfinesser i fokus och stöd för sammanlänkning med telefoner baserade på marknadens tre största operativsystem. Läs mer

58

Recension: Phanteks Enthoo Evolv

Ett avskalat utseende med en kassaskåpsliknande konstruktion av extra tjock aluminiumplåt är Phanteks recept för Micro ATX med nya Enthoo Evolv. Jonas kavlar upp ärmarna och undersöker nykomlingen i testlabbet. Läs mer

18

Windows 10 får gränssnitt för hybrider inom de närmsta månaderna

Utvecklingen av Windows 10 fortsätter och inom kort är det dags för det pekskärmsorienterade gränssnittet att finputsas, där en av finesserna blir smidigare användning med hybriddatorer. Läs mer

26

Holografisk pekskärm ger känsel med ultraljud

En minst sagt futuristisk pekskärm svävar inte bara i luften utan ger även användaren möjlighet att "röra" vid virtuella objekt. Läs mer

120

Bredbandsbolagets modem från Zyxel innehåller bakdörr

En allvarlig och ovanligt uppenbar sårbarhet upptäcks i Bredbandsbolagets modem från Zyxel. Några av de vanligaste modellerna innehåller ett förinställt och dolt administratörskonto. Läs mer

59

AMD introducerar Radeon R9 290X med 8 GB videominne i november

Mer videominne står på menyn när ett gäng utvalda AMD-partners rustar upp inför julhandeln med ett antal uppgraderade versioner av grafikkortet Radeon R9 290X. Läs mer

54

Samsung erkänner prestandaproblem med ursprungliga SSD 840

Efter att ha lagt locket på ger Samsung med sig och erkänner prestandaproblemen för SSD 840, som i nuläget undersöks och ska få en uppdatering av mjukvaran "så snart som möjligt". Läs mer

75

Battlefield: Hardline släpps i mars – följs upp av Star Wars: Battlefront och Battlefield 5

  • Spel
  • 2014-10-29 09:25

Under Electronic Arts senaste kvartalsrapport avslöjas lanseringsfönstren för flera kommande stortitlar, bland annat att Battlefield 5 är tänkt till slutet av 2016. Läs mer

Senaste nyheterna

Redaktionens senaste nyhetsrubriker

Hårdvara
Mjukvara
Övrigt
Skribent
Emil Åkered
Videoartiklar

Nvidia Tegra K1 med tesselering

Nvidias stora lansering för årets upplaga av CES är den mobila plattformen Tegra K1. Under mässan passar företaget på att demonstrera nykomlingens kapacitet.
Läs mer

SweClockers provkör Oculus Rift DK2

Virtuell verklighet är i ropet och främst i ledet står Oculus med den andra utvecklingsversionen av glasögonen Rift. Emil och Jonas delar med sig av erfarenheterna från första veckans testande.
Läs mer

Silverstone Raven RV05

Den femte inkarnationen av datorlådan Silverstone Raven tar plats i SweClockers testlabb, med finesser som en vriden moderkortsplåt och många möjligheter till ökat luftflöde.
Läs mer

Sök jobb