Att vika proteiner med Folding@home är en nobel sysselsättning bland entusiaster, där många investerar tusentals kronor i dedikerade riggar. Intresset är därför stort runt vilken hårdvara som lämpar sig allra bäst, speciellt när det kommer till moderna grafikkort.

Prestandatester har dock försvårats avsevärt av faktorer som oklara riktlinjer och att operationerna tar väldigt lång tid, där framför allt det sistnämna är en avgörande punkt. Resultatet har blivit att Folding@home i stort lyser med sin frånvaro när det kommer till större jämförelser.

Snabbtest: Prestanda i Folding@home

Nu finns det dock en lösning på problemet – officiella prestandatestet Folding@home Benchmark eller FAHBench. Programmet utför på relativt kort tid samma typer av beräkningar som vid proteinvikning, och kan därmed skilja agnarna från vetet när entusiaster jagar hårdvara till nästa supersystem.

Mjukvaran har stöd för fyra olika lägen och kan köra samtliga tester över OpenCL. Beräkningar kan hanteras explicit eller implicit, där skillnaden i korthet handlar om vilka parametrar som löpande tas hänsyn till. Förutom det kan singel- eller dubbelprecision väljas, kort och gott hur precisa tal som hanteras för flyttalsberäkningar.

Snabbtest: Prestanda i Folding@home

Vissa problem finns dock. Resultatet redovisas i smått obskyra "nanosekunder per dag", vilket är svårlänkat till traditionella Folding-måttet "Points Per Day (PPD)". Enligt användare på officiella forumet är kopplingen att varje så kallad "Work Unit" innebär delar av en simulering, vilken i sin tur representerar händelser under ett visst antal nanosekunder. Resultatet 20 ns/dag innebär alltså att 20 nanosekunder av en viss proteinvikning tar 24 timmar att beräkna.

..a WU is a part of simulation which is representing a certain amount of time. For example, a 1 000 ns simulation divided in 100 WU will make a single WU represents 10 ns. If you're folding one WU per day, you'll produce 10 ns/day ... two WU per day, 20 ns/day..

Summan av kardemumman är att ett högre värde på nanosekunder per dag innebär högre potential för proteinvikning. Värdet kan dock inte översättas rakt av till ett visst antal poäng per dag, där spelar andra faktorer in – till exempel hur komplex simuleringen är.

KomponentModell
ProcessorIntel Core i5-4670K
ModerkortMSI Z87-G45 Gaming
Minne8 GB Corsair Vengeance, 1 600 MHz, 9-9-9-24
Grafikkort
  • Gigabytes GTX 760 OC WF3X
  • Nvidia Geforce GTX Titan
  • Nvidia Geforce GTX 780
  • Nvidia Geforce GTX 770
  • Nvidia Geforce GTX 760
  • Nvidia Geforce GTX 680
  • Nvidia Geforce GTX 580
  • Nvidia Geforce GTX 480
  • AMD Radeon HD 7970 GHz
  • AMD Radeon HD 7950 Boost
  • AMD Radeon HD 7870
  • AMD Radeon HD 6970
  • AMD Radeon HD 5870
LagringSamsung 840 250 GB
NätaggregatBe Quiet Pure Power L8 630 W
SkärmAsus PB278Q
OperativsystemWindows 8 Enterprise 64-bit

Som bas används SweClockers sommardator 2013, vilken med Intel Haswell och fabriksöverklockat Geforce GTX 760 under huven innebär lagom med prestanda för de allra flesta. För att ge ytterligare kött på benen varieras grafikkortet med ytterligare tolv modeller, allt från flaggskeppet Geforce GTX Titan till mer måttliga Radeon HD 7870.

Drivrutinerna är senast tillgängliga från respektive tillverkare, vilket innebär Geforce 326.80 Beta för Nvidia samt Catalyst 13.10 beta för AMD. Observera att AMD-varianten av allt att döma visar aningen lägre prestanda jämfört med äldre versioner, dock med förbättrad stabilitet där alla deltester går igenom.

Resultat med SweClockers sommardator 2013

Först ut är en uppsjö resultat med SweClockers sommardator. Grafikkortet från Gigabyte är överklockat direkt ur kartong, och processorn testas dels i standardfrekvens, dels överklockad till 4,2 GHz för att ge extra spelrum. Inställningarna som testas är samtliga fyra alternativ mjukvaran erbjuder.

i5-4670K (3,4 GHz)i5-4670K (4,2 GHz)GB GTX 760 OC WF3X
Explicit, SP3,63 ns/dag4,16 ns/dag31,87 ns/dag
Implicit, SP3,78 ns/dag4,36 ns/dag120,28 ns/dag
Explicit, DP2,47 ns/dag2,83 ns/dag4,76 ns/dag
Implicit, DP2,33 ns/dag2,71 ns/dag6,38 ns/dag

Med de första resultaten i hand är det tydligt att proteinvikning gör sig bäst på grafikprocessorer. Trots en modern processor ur generation Haswell är sommardatorns fabriksöverklockade Geforce GTX 760 betydligt snabbare – över 30 gånger vid implicita beräkningar med singelprecision.

  • Bildspel
  • Bild 1 av 2
  • Diagram
  • Diagram
  • Bildspel
  • Bild 1 av 2

Vid singelprecision är det helt klart Nvidias Kepler-arkitektur som tar ledningen, med mäktiga Geforce Titan bekvämt parkerat i toppen. Bland AMD:s modeller hamnar föga överraskande Radeon HD 7970 GHz överst, med rejäl marginal till föregående flaggskepp Radeon HD 6970. Det har helt klart hänt en del på beräkningsfronten.

  • Bildspel
  • Bild 1 av 2
  • Diagram
  • Diagram
  • Bildspel
  • Bild 1 av 2

För dubbelprecision kastas tabellen runt ordentligt. Radeon HD 7970 GHz klättrar upp till en övertygande andraplats, endast övertrumfat av Geforce Titan i kortets speciella läge för just dubbelprecision. Intressant är också att både Geforce GTX 580 och GTX 480 klättrar förbi modernare Kepler – de sistnämnda faller rejält i tabellen med mer exakta tal att hålla reda på.

Officiella prestandatestet för Folding@home finns att ladda ned från en separat webbplats. Mjukvaran baseras på projektets senaste kärna, FAHCore 17.

Vik proteiner med Folding@home

Folding@home är ett projekt vid amerikanska Stanford University, som syftar till att använda outnyttjad datorkraft för att beräkna hur proteiner viker sig. Målet är att finna vägar hur allvarliga sjukdomar som Alzheimers uppstår och kan botas. Sammanlagt har forskarna publicerat över 100 vetenskapliga artiklar med upptäckter från beräkningsprojektet.

Snabbtest: Prestanda i Folding@home

Utöver forskning innehåller projektet även ett tävlingsmoment för att uppmana till fler deltagare. Det enda som krävs för att vara med är att installera ett litet klientprogram som kan utnyttja allt ifrån flerkärniga processorer till grafikkort och spelkonsoler för att vika proteiner. Hjälp till du med!

Instruktioner

  1. Ladda ned den officiella Folding-klienten.
  2. Installera och starta programmet
  3. Välj ett användarnamn
  4. Ange lagnummer (team number) 37451 för att gå med i SweClockers lag

Mer information om Folding@home finns i forumet.

Fotnot: Även om processen för Folding@home i normalfall körs med låg prioritet innebär den konstant hög belastning av datorsystemet. Det är därför viktigt att hålla koll på kylning och temperaturer för att undvika instabilitet.

23

VESA tar Displayport till USB Type-C

Den mångsidiga USB-standarden får ytterligare en finess när VESA möjliggör överföring av ljud och bild via Displayport med den nya konktakttypen USB Type-C. Läs mer

31

Corsair Gaming lanserar K70 och K95 med Cherry MX RGB

Efter många om och men lanserar Corsair de första tangentborden med RGB-belysta brytare från Cherry. Samtidigt sjösätts ett nytt gamingvarumärke. Läs mer

34

Cooler Master lanserar tangentbordet Novatouch TKL med hybridbrytare

Ett påkostat tangentbord med Topre-liknande brytare är Cooler Masters senaste drag för att ge den rätta känslan för såväl gamers som flitiga programmerare och skribenter. Läs mer

104

Shield Controller till PC – men endast med Geforce

Handkontrollen Shield Controller får nu stöd för PC/Windows, men det är inte utan begränsningar. På kravlistan står Geforce-grafikkort och mjukvaran Geforce Experience. Läs mer

46

Grand Theft Auto V får förstapersonsläge

I den kommande nyutgåvan av GTA V för PC och den nya generationens spelkonsoler tillkommer en hel del nyheter, däribland ett nytt förstapersonsläge i både fordon och till fots. Läs mer

16

Google Nexus 9 från HTC på ingång

Att nästa surfplatta märkt Google Nexus är en kreation från HTC stärks av ännu en rapport, som gör gällande att Google vill förhindra monopol på marknaden för Android-surfplattor. Läs mer

83

Oculus presenterar Rift "Crescent Bay"

Nästa generation av VR-glasögonen Oculus Rift kallas för Crescent Bay och levererar nyheter som inbyggt ljud och 360-graders rörelsespårning. Läs mer

41

Nvidia direktsänder speleventet Game24 från Webhallen i Stockholm

  • Spel
  • 2014-09-19 15:54

Från Shanghai, London och Los Angeles till Stockholm och Webhallens butik på Sveavägen. Med evenemang över hela världen firar Nvidia lanseringen av Geforce GTX 900-serien. Läs mer

37

Samsung S27D590C är välvd 27-tummare med VA-panel

Skärmpaneler med kurvatur dyker upp på alla håll och kanter, där konceptet framförallt blivit stort på tv-marknaden. Nu släpper Samsung en välvd datorskärm med VA-panel. Läs mer

38

Zotac släpper Geforce GTX 980 och GTX 970 AMP med påkostade kretskort

När Nvidia lanserar Maxwell för prestandasegmentet slår Zotac på stort med skräddarsydda grafikkort, som får allt från tilltagna kretskort till rejält uppvridna klockfrekvenser. Läs mer

89

Euclideon Unlimited Detail tillbaka med "världens mest realistiska grafik"

  • Spel
  • 2014-09-19 12:31

Det kontroversiella företaget Euclideon visar upp en ny videosnutt från grafikmotorn Unlimited Detail, som sägs kunna revolutionera datorgrafiken med så gott som oändlig detaljrikedom. Läs mer

544

Recension: Nvidia Geforce GTX 980 och GTX 970

Klockan är slagen och det är dags att presentera två av höstens mest uppmärksammade grafikkort. SweClockers laddar testbänkarna med inget mindre än Geforce GTX 900-serien. Läs mer

33

Nvidia utlovar stöd för G-Sync-konkurrenten Adaptive-Sync

Det är inte bara AMD som vill utnyttja Displayport Adaptive-Sync för att åstadkomma dynamiska uppdateringsfrekvenser. Nvidia planerar stjäla rampljuset och göra detsamma, trots att tekniken konkurrerar med G-Sync. Läs mer

34

Nvidia skrotar Geforce GTX 770, GTX 780, GTX 780 Ti – prissänker GTX 760

Lanseringen av Geforce GTX 980 och GTX 970 skakar om prestandasegmentet och ersätter flera modeller i GTX 700-serien. Samtidigt prissänks mellanklasskortet GTX 760. Läs mer

Sök jobb