Nej, men tänk på att nekande rättigheter går över tillåtande.
Tex Admin tillåts skriva och läsa, men gruppen administratörer nekas skriva => du som admin kan bara läsa.
NTFS fungerar så att varje mapp och varje fil har sin rättighet, kopplat till Windows konto (via en unik ID) om jag minns rätt. De kan ärva rättigheterna från underliggande mapp och/eller bygga på helt egna.
När man installerar om så genereras ett nytt ID och man måste ev tillåta en att komma åt "andras" info (då lägga till rättigheter) för att du som ny användare ska kunna använda det.
Dock är det lite skumt i ditt fall, då du har detta felet på nuvarande disk och inte på extra HDDn som man normalt förväntar sig detta felet.
Det finns sätt att återställa rättigheterna, men det kan skada saker också, så ta backup på innehållet först!
http://lallouslab.net/2013/08/26/resetting-ntfs-files-permiss...
eller om du vill göra det manuellt:
http://lallouslab.net/2009/06/14/resetting-ntfs-files-securit...