Är det dumt att skapa stora .zip filer för backup?

Hej!

När jag tar snapshot backup av stora mappar som t.ex. alla mina bilder brukar jag zippa hela mappen vilket skapar en fil på ca 200GB. Nu har jag tänkt göra det på större mappar upp mot 2TB. Anledningen att jag vill zippa mina backuper är för att när jag tidigare bara kopierat mappen till min externa hårddisk har jag senare märkt att det på något vis försvunnit filer.

Det kan förstås vara jag som råkat radera av misstag. Men om jag zipar min backup borde inte innehållet kunna ändras va?

Är det någon risk med att göra stora .zip filer jämfört med att skapa arkiv som består av flera filer?

Tar gärna emot övriga tips och förslag på hur man bäst sparar snapshots av viktiga filer.

(Använder OS X)

Om jag t.ex. skulle råka radera en fil eller skulle behöva gå tillbaka till en gammal version av en fil tycker jag inte timemachine känns pålitligt nog. På mina viktigaste filer har jag gjort så att jag två gånger om året kopierar över dem till en extern hårddisk i en mapp som heter t.ex. "Backup 2014-01-01"

Så på min externa hårddisk har jag mappar som kan se ut så här:

Backup 2012-01-01"
Backup 2012-06-01"
Backup 2013-01-01"
Backup 2013-06-01"
Backup 2014-01-01"

Om jag då skulle märka att jag råkat radera en fil så kan jag gå tillbaka till mina backuper.

Nu själva problemet är att när jag gjort det så har det saknats massor av filer i mina backuper trots att jag vet att jag inte råkat radera något. Vad det beror på vet jag inte, men filer har alltså försvunnit från min backup. Jag har använt mig av en NTFS disk i OS X så kanske jag råkat ut för en bugg i Paragons NTFS drivrutin. Nu kör jag med HFS+ på min externa hårddisk.

Så frågan är hur ska jag kunna hålla reda på att alla mina filer finns kvar i mina backuper?

I en .zip borde inte en fil kunna försvinna, men det är klart att hela arkivet kan bli korrupt istället...