Är inte helt säker på vad du gör, men du kan koppla Thunderbird till flera mailkonton.
Men vill du att det skall vara helt "rent" så kanske du skall skapa en ny användare på datorn och börja från "noll" såatt säga. Det verkar som om du inte lyckats "städa" den profil som Thunderbird har utan bara en del av datat.
Kataloger:
C:\Users\<user>\AppData\Local\Thunderbird\Profiles
C:\Users\<user>\AppData\Roaming\Thunderbird\Profiles
Du kan även editera C:\Users\<user>\AppData\Roaming\Thunderbird\profiles.ini och ändra så att det står StartWithLastProfile=0 under [General], då får du en fråga när du startar Thunderbird om du vill skapa en ny profil. Då skall du få en helt "ren" profil.
Hoppas detta hjälper.