SATA 6 Gb/s @ GA-P55A-UD4?

I handboken står det om BIOS-inställningar(Kap 2-6 sid 53) : Turbo SATA3 / USB3.0 (Marvell 9128 /NEC USB 3.0 Controller)
Determines whether to set the PCIe speed of the Marvell 9128 or NEC USB 3.0 controller to PCIe Gen
2. Please note that when only one graphics card is installed on the PCIEX16 slot, it will operate at up to
x8 mode if either one of the two controllers is set to PCIe Gen 2. The two controllers will be automatically
set to PCIe Gen 1 when two graphics cards are installed on the PCIEX16 and PCIEX8 slots.

Auto Lets the BIOS automatically configure this setting, depending on the device installed.
(Default)
Turbo SATA3 Sets the PCIe speed of the Marvell 9128 controller to PCIe Gen 2.
Turbo USB3.0 Sets the PCIe speed of the NEC USB 3.0 controller to PCIe Gen 2.
Disabled Disabled forces the Marvell 9128 and NEC USB 3.0 controllers to PCIe Gen 1.

Så det verkar ju som PCIe påverkas om man väljer att köra i SATA 6 Gb/s genom denna kontroller, i ditt fall borde det ju inte spela någon roll eftersom dina grafikkort redan går i x8.
Funderar själv över frågan om man blir tvungen att använda Intel portarnas 3 Gb/s för att SSD:n ska fungera optimalt(väntar på leverans av Intels 510 120GB).

Du kommer förmodligen inte kunna få ut maximal fart med en Intel 510 PGA av att moderkortet har en Marvel controller som det har framkommit att det inte blir full fart med i tester. Du bör ha ett Sandy bridge med native Sata 6 Gbit för att kunna utnyttja gränssnittet fullt ut. Så jag skulle nog ta en Intel 320 eller byta moderkortet om man vill få ut max prestanda.

Sen så står det detta angående 2 grafikkort.
When dual graphics cards are used in 1st and 2nd PCIex16 slots, SATA3 / USB 3.0 (Marvell 9128 /NEC USB 3.0 Controllers) will work at normal mode.

http://www.guru3d.com/article/ocz-vertex-3-pro-review/13