Vill du vara del av diskussionerna i forumet, ställa frågor eller hjälpa andra? Registrera dig här!

Vik protein för att bekämpa coronaviruset med Folding@home

Trädvy Permalänk
Cyberman
Registrerad
Dec 1999

Vik protein för att bekämpa coronaviruset med Folding@home

Mjukvaran som låter användare bjuda på outnyttjade datorresurser till att vika protein tar nu sikte på att på att bearbeta coronaviruset.

Läs hela artikeln här

Observera att samma trivselregler gäller i kommentarstrådarna som i övriga forumet och att brott mot dessa leder till avstängning. Kontakta redaktionen om du vill uppmärksamma fel i artikeln eller framföra andra synpunkter.

Trädvy Permalänk
Sjusovarn
Registrerad
Feb 2017

Finns det några studier som faktiskt bevisar att Folding@Home gör någon nytta?

Trädvy Permalänk
Medlem
Registrerad
Apr 2008
Skrivet av My2nd:

Finns det några studier som faktiskt bevisar att Folding@Home gör någon nytta?

https://foldingathome.org/papers-results/

Edit: Lite mer lättläst. https://en.wikipedia.org/wiki/Folding@home#Examples_of_applic...

Trädvy Permalänk
Proffsmoddare
Plats
Västerås
Registrerad
Jun 2006
Skrivet av My2nd:

Finns det några studier som faktiskt bevisar att Folding@Home gör någon nytta?

Ser gärna också något resultat från tidigare folding.
Diskussionen kring klimatpåverkan blir ju annars ganska nära till hands.

Edit: Tack @mangethegamer för lite läsbart!

CRATER | VISION | TILT | CORE X | IRIS | TORQUE | AVOID | BLACKOUT | ISO
Instagram: timpelay Facebook: timpelay

Trädvy Permalänk
Medlem
Plats
Stockholm
Registrerad
Okt 2008

Trevligt att folding hoppar igång igen. Det kändes så gemytligt förr.

Ryzen 5 3600X, 16GB DDR4 @ 3200mHz, GTX 1080TI, 2TB SSD

Trädvy Permalänk
Medlem
Plats
Ghost Town
Registrerad
Dec 2014

Så allt man behöver göra är att installera programmet så använder dem våra "datorer" för att forska på det eller tolkar jag det lite fel?

3800X4.4Ghz GTX 1080Ti Asus TUF B450M-PROGaming 32GB 3000Mhz
I7 5960x Custom Loop 32GB RTX 2060 Streaming/Recording pc.
"Retro" i7 975X/ Asus Sabertooth X58 24GB 1600Mhz GTX 470 Sli
Test Bench 6700K/4770k/3770K 32GB/i7920 24GB
Hemma Server HP Compaq 6200 Pro i3

Trädvy Permalänk
Medlem
Plats
Tullinge
Registrerad
Jun 2005

kollade wikipedia sidan och det verkar som det hjälper ganska mycket att folda, istället för att hyra eller eller helt enkelt strunta i att göra beräkningarna för att det skulle ta år för en ensam dator så kan det ta dagar istället när flera tusen datorer hjälps åt.
kanske ska testa detta, har funderat på det ett tag och jag sätter här själv med influensan så det känns även rätt just nu

Ryzen 3700x @ auto, Palit GTX 1080 GR Premium

Trädvy Permalänk
Medlem
Plats
Norrköping
Registrerad
Jan 2011
Skrivet av ExcZist:

Så allt man behöver göra är att installera programmet så använder dem våra "datorer" för att forska på det eller tolkar jag det lite fel?

"Användare som installerar mjukvaran delar beräknad data med ett forskarlag vid Memorial Sloan Kettering-universitetet där arbete utförs med att bättre förstå coronavirusets struktur"

Det lämnar inte så mycket tolkningsutrymme

Trädvy Permalänk
Medlem
Plats
Ghost Town
Registrerad
Dec 2014
Skrivet av dlq84:

"Användare som installerar mjukvaran delar beräknad data med ett forskarlag vid Memorial Sloan Kettering-universitetet där arbete utförs med att bättre förstå coronavirusets struktur"

Det lämnar inte så mycket tolkningsutrymme

Inte lätt när man är trött
Ptja hade det inte blivit så dyrt att ha igång datorer pga Elen så hade man ju kunnat kört flera datorer så har dem ju gott om resurser lol XD

3800X4.4Ghz GTX 1080Ti Asus TUF B450M-PROGaming 32GB 3000Mhz
I7 5960x Custom Loop 32GB RTX 2060 Streaming/Recording pc.
"Retro" i7 975X/ Asus Sabertooth X58 24GB 1600Mhz GTX 470 Sli
Test Bench 6700K/4770k/3770K 32GB/i7920 24GB
Hemma Server HP Compaq 6200 Pro i3

Trädvy Permalänk
Medlem
Plats
Bromma
Registrerad
Mar 2011
Skrivet av dlq84:

"Användare som installerar mjukvaran delar beräknad data med ett forskarlag vid Memorial Sloan Kettering-universitetet där arbete utförs med att bättre förstå coronavirusets struktur"

Det lämnar inte så mycket tolkningsutrymme

Man kan även välja vilka sorters forskningsprojekt man vill stödja. Även de statistik etc på hemsidan

Trädvy Permalänk
Medlem
Plats
Skaune
Registrerad
Okt 2002

Har foldat tidigare men har glömt av det allt eftersom åren går.
Körde igång och kopplade på på SweC's team. Dock ser jag inte någon möjlighet att välja Corona-viruset utan det är de vanliga stora; Parkinson's, Alzheimer's, Cancer och Huntington's.

Förslag? Kommentarer?

🟢 Main: Ryzen7 2700X | Strix x470-I | 32GB | GTX1070 | Samsung C49RG9
🔵 unRaid: Ryzen5 2600 | B450M DS3H | 32GB
🟠 Tfn: OnePlus 6T Thunder Purple

-:| @ eller citera för svar |:-

Trädvy Permalänk
Medlem
Plats
Purgatory
Registrerad
Mar 2004
Skrivet av ExcZist:

Inte lätt när man är trött
Ptja hade det inte blivit så dyrt att ha igång datorer pga Elen så hade man ju kunnat kört flera datorer så har dem ju gott om resurser lol XD

Men en varm dator värmer även ditt hem, så en total förlust är det inte

Ryzen 2700X, Msi B450 Tomahawk, Vega 64, 32 Gb Corsair Vengeance Pro, hemmasnickrad vattenkylning.

Trädvy Permalänk
Medlem
Plats
Ghost Town
Registrerad
Dec 2014
Skrivet av Aldric T:

Men en varm dator värmer även ditt hem, så en total förlust är det inte

Det är tillräckligt varmt med 1 dator och elementet av
Svettas som en idiot så fönstret är öppet på dagen

3800X4.4Ghz GTX 1080Ti Asus TUF B450M-PROGaming 32GB 3000Mhz
I7 5960x Custom Loop 32GB RTX 2060 Streaming/Recording pc.
"Retro" i7 975X/ Asus Sabertooth X58 24GB 1600Mhz GTX 470 Sli
Test Bench 6700K/4770k/3770K 32GB/i7920 24GB
Hemma Server HP Compaq 6200 Pro i3

Trädvy Permalänk
Medlem
Plats
Göteborg
Registrerad
Dec 2017

Till de som sitter och funderar på om proteinveckningsanalys in silico faktiskt är något som fungerar och om man gör nytta så är svaret ett rungande ja. Som tidigare nämnts i tråden så kan man kolla in https://foldingathome.org/papers-results/ för projektets egna publikationslista av artiklar som dragit nytta av projektet.

Vad som däremot skall sägas är att de resultat som simuleringarna ger är mycket prekliniska till sin natur. Detta innebär att man efter att ha gjort sina strukturanalyser måste testa dessa syntetiserade i fysisk form isolerat, sedan i cellmodeller, djurmodeller, i kliniska studier osv. I varje steg faller majoriteten från föregående steg bort.

Man skall alltså inte installera F@H-klienten i tron om att man genom att bidra med klockcykler kommer att bromsa det aktuella utbrottet av SARS-CoV-2. Med största sannolikhet kommer majoriteten att bidra med förståelse för vad som ej fungerar (så fungerar tidig medicinsk forskning). Vad man däremot kan göra är att bidra med resurser till en mycket liten kugge i det enorma maskineri som långsamt arbetar sig framåt inkrementellt kallad medicinsk vetenskap.

/En f.d. ingenjör som skolade om sig till läkare

Trädvy Permalänk
Medlem
Plats
Sörmland
Registrerad
Jul 2012

Skulle ha passat på att vara med i dessa projekt när jag bodde i studentkorridor och elen var inkluderad i hyran. Då hade jag i och för sig en dator som lät som en hes dammsugare på steroider.

i5 8400 / Gigabyte B360N Wifi / Sapphire R9 Nano / Raijintek Metis / Silverstone SX500-LG / Corsair Vengance LPX 16 GB DDR4 @ 2666mhz / Sandisk A110 & OCZ Trion 150 / Silverstone Argon AR-01

Lenovo Ideapad 700-15ISK - i5 6300HQ / GTX 950M 4Gb / 12 Gb DDR4

Trädvy Permalänk
Medlem
Plats
Härnösand
Registrerad
Mar 2014

Superbra initiativ!
Elen ingår i min hyra, och att bara låta en 3700X och 2070 stå och samla damm när jag är ute känns lite onödigt när det kan göra riktig allmännytta.
Blir till att stänga av elementet antar jag.

Hmm, nu måste jag ju leta åt fästena till att klämma fast Pure rocken på syrrans cpu så den inte slits så fasligt.

Trädvy Permalänk
Medlem
Plats
Karlskoga
Registrerad
Feb 2005

Hmm hittar inte corona joxxet i listan? :S

| Asus Zenbook UX430UN | Intel i5 8250U | 8 GB DDR4 | MX150 | m.2 - 256GB SSD |
| Steam - Toivo |

Trädvy Permalänk
Medlem
Plats
Landvetter
Registrerad
Maj 2002

@Dimestam
Några av länkarna i ditt inlägg #15162447 är brutna. Passar bra att uppdatera nu, speciellt länken till programvaran.

Ryzen 3800X - Asus Prime X370-Pro - Noctua NH-D15 - ASUS STRIX OC RTX 2080 Ti - Corsair Vengance LPX 16Gb 3200 MHz - Samsung 960 EVO m.2 - Corsair TX650M V3 - Dell S2417DG 144Hz G-sync

Trädvy Permalänk
Medlem
Plats
M-Skåne
Registrerad
Aug 2009

2 desktops som går nästan dygnet rynt med sena Ryzen kärnor samt 2 servrar som går 24/7 med Xeon och Opteron kärnor sparkas igång ikväll.

Satt och väntade på detta.

Trädvy Permalänk
Medlem
Registrerad
Maj 2013

För oss som föredrar BOINC kan man bidra med samma sak med hjälp av projektet Rosetta@home

Trädvy Permalänk
Medlem
Plats
M-Skåne
Registrerad
Aug 2009
Skrivet av Toivo83:

Hmm hittar inte corona joxxet i listan? :S

Lite nyfiken på det med, har satt det på General just nu, men avvaktar instruktioner som verkar saknas, både här och på FOH siten

Trädvy Permalänk
SweClockers
Andreas Dimestam
Plats
Stockholm
Registrerad
Apr 2002
Skrivet av AmpRC:

@Dimestam
Några av länkarna i ditt inlägg #15162447 är brutna. Passar bra att uppdatera nu, speciellt länken till programvaran.

Tack! Det är nu fixat.

Trädvy Permalänk
Medlem
Plats
Sollentuna
Registrerad
Maj 2007

Åhå! Dags att testa ens överklocks stabilitet på allvar då!

i9-7920X Delid | 64GB DDR4 | ASUS WS X299 PRO | GTX 1080 Ti | Define C | 5x 500GB SSD

Trädvy Permalänk
Medlem
Registrerad
Sep 2018
Skrivet av lhugo:

/En f.d. ingenjör som skolade om sig till läkare

En kille med rejäla studielån med andra ord

Trädvy Permalänk
Hedersmedlem
Plats
Hälsingland
Registrerad
Jan 2002

Saknar faktiskt foldandet men inget jag lär återvända till någonsin.

"Arm yourself because no-one else here will save you. The odds will betray you"
Fractal Design Define R5 Blackout, Ryzen 3900X, MSI MPG X570 Gaming Pro Carbon WiFi, 32GB DDR4 3000MHz@CL15, Ca 5TB SSD, Gainward 1080Ti Phoenix Golden Sample, Acer X34A + Acer XB271HU + Oculus Rift + Quest

Trädvy Permalänk
Medlem
Plats
Värmland
Registrerad
Feb 2019

Äntligen fick jag användning för alla mina cpu kärnor, iofs tycker jag mest att det är grafikkortet som svettas.

Ryzen 7 3800x / Fractal Design celsius s24 / asus rog crosshair 7 hero wifi / 32gb g.skill 3600mhz cl16 trident Z neo C / MSI Radeon RX5700XT Gaming X / samsung 970 EVO Plus 500gb nvme / Western Digital blue 500gb ssd.

Trädvy Permalänk
Medlem
Plats
Numera Malmö (igen)
Registrerad
Jan 2009
Skrivet av GreyWilk:

Har foldat tidigare men har glömt av det allt eftersom åren går.
Körde igång och kopplade på på SweC's team. Dock ser jag inte någon möjlighet att välja Corona-viruset utan det är de vanliga stora; Parkinson's, Alzheimer's, Cancer och Huntington's.

Förslag? Kommentarer?

Skrivet av Toivo83:

Hmm hittar inte corona joxxet i listan? :S

Håller med – inte helt tydligt om det är proteiner relaterade till Corona-viruset ens dator räknar på även om det verkar så enligt artikeln på Folding@home-sajten:

https://foldingathome.org/2020/02/27/foldinghome-takes-up-the...

Mac Pro (Mid 2010) | 3,33 GHz 6-Core Intel Xeon ”Westmere” | 32 GB RAM | Radeon RX 5700 XT, 8 GB | MacOS 10.15: Samsung 970 EVO Plus, 1 TB | Windows 10: Samsung 850 EVO, 256 GB | Samsung 850 Pro, 512 GB | WD Black, 6 TB | Seagate Barracuda, 8 TB | LG DVD bränn/Blu-ray läs | 2x USB 3.1 (Gen 2) via Sonnet Technologies Allegro USB-C PCIe

Trädvy Permalänk
Medlem
Registrerad
Apr 2002
Skrivet av star-affinity:

Håller med – inte helt tydligt om det är proteiner relaterade till Corona-viruset ens dator räknar på även om det verkar så enligt artikeln på Folding@home-sajten:

https://foldingathome.org/2020/02/27/foldinghome-takes-up-the...

Mnjae, det låter som en tveksam slutsats. Artikeln säger väl att det är ett nytt projekt som F@H nu KAN räkna på.

Det står väl vad din dator räknar på om du öppnar själva F@H-kontrollpanelen?

Ser ut något sånt här:

(Om du räknar med både CPU och GPU så får du klicka på respektive för att se vilka projekt de kör.)

AMD Ryzen7 3800X || Gigabyte X570 Ultra || Evga GTX 1080Ti || Crucial Ballistix Sport 3200 64GB || Samsung 950 Pro 512GB || Samsung 960 Pro 1024GB || XB270HU 1440p IPS G-Sync

Trädvy Permalänk
Medlem
Plats
Numera Malmö (igen)
Registrerad
Jan 2009
Skrivet av evil penguin:

Mnjae, det låter som en tveksam slutsats. Artikeln säger väl att det är ett nytt projekt som F@H nu KAN räkna på.

Det står väl vad din dator räknar på om du öppnar själva F@H-kontrollpanelen?

Ser ut något sånt här:
https://foldingathome.org/wp-content/uploads/2014/03/fahclient-v7.4.4-webcontrol-screenshot-medium1.png

(Om du räknar med både CPU och GPU så får du klicka på respektive för att se vilka projekt de kör.)

Du har rätt. Det står ”can”:

By downloading Folding@Home, you can donate your unused computational resources to the Folding@home Consortium, where a research team at Memorial Sloan Kettering is working to advance our understanding of the structures of potential drug targets for 2019-nCoV that could aid in the design of new therapies.

Ser ut som du kör webb-klienten där. Av någon anledning kan jag inte ansluta till den utan bara köra programmet ”FAHControl” (i MacOS).

Mac Pro (Mid 2010) | 3,33 GHz 6-Core Intel Xeon ”Westmere” | 32 GB RAM | Radeon RX 5700 XT, 8 GB | MacOS 10.15: Samsung 970 EVO Plus, 1 TB | Windows 10: Samsung 850 EVO, 256 GB | Samsung 850 Pro, 512 GB | WD Black, 6 TB | Seagate Barracuda, 8 TB | LG DVD bränn/Blu-ray läs | 2x USB 3.1 (Gen 2) via Sonnet Technologies Allegro USB-C PCIe

Trädvy Permalänk
Medlem
Registrerad
Apr 2002
Skrivet av star-affinity:

Du har rätt. Det står ”can”:

By downloading Folding@Home, you can donate your unused computational resources to the Folding@home Consortium, where a research team at Memorial Sloan Kettering is working to advance our understanding of the structures of potential drug targets for 2019-nCoV that could aid in the design of new therapies.

Ser ut som du kör webb-klienten där. Av någon anledning kan jag inte ansluta till den utan bara köra programmet ”FAHControl” (i MacOS).

Ja, jag vet inte om man får se den här mer användarvänliga projektbeskrivningen i FAHControl, men projektid vet jag visas iaf.

Om inte annat kan du då kan du slå upp ditt projektid här: https://apps.foldingathome.org/psummary och se projektbeskrivningen.

AMD Ryzen7 3800X || Gigabyte X570 Ultra || Evga GTX 1080Ti || Crucial Ballistix Sport 3200 64GB || Samsung 950 Pro 512GB || Samsung 960 Pro 1024GB || XB270HU 1440p IPS G-Sync