Kaos i mp3 samlingen

Jag provade nyligen ett för mig nytt mp3 uppspelnings program, foobar. Innan har jag använt mig av iTunes som har varit bra, men som också tyvärr börjar gå rätt trögt när mp3 samlingen vuxit. Efter att ha provat foobar och upptäckt att dess iPod-plugin inte funger valde jag att gå tillbaks till iTunes. Nu är det dock så att filerna som spelats upp / taggats i foobar inte går att tagga om i iTunes! De har blivit permanent taggade av foobar. Vissa av filerna går heller inte längre att spela upp i iTunes (dock går det fortfarande i WMP).
Strukturen, som är viktig när man har uppemot tio tusen låtar, har blivit tillintegjord. Den har blivit foobar. Kan någon hjälpa mig? Jag skulle vara oerhört tacksam!