Man är en random bartender som har tagits in av ett à la Umbrella Corp. företag vilka inga vet om... Företaget håller nu på med nån forskning om hur vi kan lagra våra förfäders minnen i våra gener.
Företaget letar efter något från det förflutna och har därför tagit in dig (bartendern) för att kunna gräva i dina gener. Men för att de ska kunna göra det så skickas du in i tankens värld tillbaka i tiden för att då spela rollen som Altair, och arbetar dig fram igenom förstörda minnen som du i princip fyller i igenom att klara dina uppdrag i spelet.
Jag har nu dödat 7 av de 9 "onda" som man är ute efter och väntar med spänning på vad Sinan (Leader of the Assassins) har i åtanke. För efter man dödar en huvudperson så berättar dom en liten story som får en att börja tänka efter vilka som egentligen är de goda och de onda i sammanhanget.