SweClockers foldinglag begär förstärkning

Får inte det där programmet att funka, jag behöver en for dummies guide tror jag. O_o

Den tar 70% av CPU'n bara när du har displayen uppe eller hur.

Tror inte det skulle vara så många som foldade om det inte var för poängen, folk gör vad som helst för poäng, oavsett vad för poäng det är.

La till Klienten, men det står så här om man har logg-rutan uppe och trycker F5:

[14/08/08 - 03:47:36] Läser in Japp igen
[14/08/08 - 03:47:36] X Fel vid inläsning av C:\Program Files (x86)\Folding@home\Folding@home-gpu\FAHlog.txt!

Såg att FAHlog.txt fanns inne i C:\Program Files (x86)\FahMon Så jag ändrade till den adressen istället. Då verkade det funka, men det står 0% på den och den kan inte beräkna sluttiden?
Har startat om folding-klienten men det blev inte bättre. Har 17000/25000 nu och tickar uppåt, är klar om 45 min.

Står så här i loggrutan:
[14/08/08 - 03:57:44] X Fel vid inläsning av C:\Program Files (x86)\FahMon\unitinfo.txt!
[14/08/08 - 03:57:44] Japp är stoppad (hittade raden "Folding@Home Client Shutdown.")

Fan att den här skiten ska vara så jävla krånglig. Det som följer med PS3 är ju så mycket bättre! Man behöver inte göra ett skit förrutom att ange nick och teamnr, sen är det sjukt snyggt så man vill ha det som skärmsläckare.

Ja men jag har ju anus-vista, hur gör jag då? Jag är admin men jag kommer inte åt Documents and Settings, ser inte ens mappen, står Access denied när jag skriver in genvägen direkt i utforskaren.
Vista är ett riktigt jävla skit-OS när det gäller restriktioner. Fan jag är ju admin men har noll kontroll över min egna burk. :/

Edit: Never mind, fick googla efter instruktioner för att se dolda mappar, då gick det till slut.
C:\Users\*****\AppData\Roaming\Folding@home-gpu <-- sådär

Nu funkar det.

Min totala PPD är 5841 säger den, är det nått bra mått på hur snabbt jag foldar eller?

Men vad är det jag ska kolla på? Points 24hr Avg? Blir inte det rätt så fel iom att den mäter hur många points man fixat över en 24-timmarsperiod? Om man tagit pauser så får man ju sämre där väl?

Jag vill veta hur snabb min burk är på att räkna jämfört med andra, då är det väl bättre med typ points per second eller minute? Annars måste jag ju låta burken vara på i 24 timmar och sen förmoda att alla andra också haft sina på i 24h för att en jämförelse skall stämma. O_o?

57. Structural Insight into RNA Hairpin Folding Intermediates

Gregory R. Bowman, Xuhui Huang, Yuan Yao, Jian Sun, Gunnar Carlsson, Leonidas J. Guibas, and Vijay S. Pande

J. Am. Chem. Soc., 130 (30), 9676–9678, 2008

ABSTRACT. Hairpins are a ubiquitous secondary structure motif in RNA molecules. Despite their simple structure, there is some debate over whether they fold in a two-state or multi-state manner. We have studied the folding of a small tetraloop hairpin using a serial version of replica exchange molecular dynamics on a distributed computing environment. On the basis of these simulations, we have identified a number of intermediates that are consistent with experimental results. We also find that folding is not simply the reverse of high-temperature unfolding and suggest that this may be a general feature of biomolecular folding.

56. Convergence of folding free energy landscapes via application of enhanced sampling methods in a distributed computing environment.

Xuhui Huang,Gregory R. Bowman,and Vijay S. Pande

J Chem Phys. 2008 May 28;128(20):205106.

ABSTRACT.We have implemented the serial replica exchange method (SREM) and simulated tempering (ST) enhanced sampling algorithms in a global distributed computing environment. Here we examine the helix-coil transition of a 21 residue alpha-helical peptide in explicit solvent. For ST, we demonstrate the efficacy of a new method for determining initial weights allowing the system to perform a random walk in temperature space based on short trial simulations. These weights are updated throughout the production simulation by an adaptive weighting method. We give a detailed comparison of SREM, ST, as well as standard MD and find that SREM and ST give equivalent results in reasonable agreement with experimental data. In addition, we find that both enhanced sampling methods are much more efficient than standard MD simulations. The melting temperature of the Fs peptide with the AMBER99phi potential was calculated to be about 310 K, which is in reasonable agreement with the experimental value of 334 K. We also discuss other temperature dependent properties of the helix-coil transition. Although ST has certain advantages over SREM, both SREM and ST are shown to be powerful methods via distributed computing and will be applied extensively in future studies of complex bimolecular systems.

Samt http://www.nzherald.co.nz/section/1/story.cfm?c_id=1&objectid...

Kör folding nu sedan ca 03:00 inatt Prollen (se sing) ligger på max när jag kör programmet. Kan man ställa in så den bara går igång vissa tider eller efter en visst tids inaktivitet? Datorn blir ju så seg annars För övrigt kul att hjälpa till. Har tidigare trott att det krävs en superdator för att köra detta men det funkar ju faktiskt på min lilla burk 60 grader på prollen efter ca 5 timmar på 100% är ju inte så farligt ändå

Håller med ovanstående att en separat del på sidan inte skulle skada.

Edit: Lade in programmet under schemalagda aktiviteter så problemet med att få det att starta av sig själv är löst

Ok, nu är jag också med i laget då. Blir bättre om ett par veckor när jag köpt ny dator dessutom.

/hulle.