Problem med att boota Ubuntu

Hej,
Försöker köra Ubuntu på min dator (konfigurering enl nedan) och har tagit bort Vista-partitionen. Går bra att köra Ubuntu 32bit 8.04 och 64bit 8.10 från CD men när jag installerar på hårddisken och blir ombedd att starta om får jag efter BIOS svartskärm med texten "disk boot failure, insert system disk and press enter". Detta funkar dock inte och jag blir tvungen att resetta datorn och köra från CDn igen. Vad göra?
Tack för svar,

tack för svaret. verkar lite mystiskt iof eftersom hårddiskarna syntes och stöddes och allt. nu provade jag att installera opperativsystemet på den andra hårddisken och då funkade det bra. det gick även att installera en ny boot på den första hårddisken (en raptor). nu har jag dock problem med att radera den partition jag inte vill använda och jag har fått massa skräp partitioner på kuppen av mina olika försök. hur tar jag bort/raderar partitionen jag inte vill ha och hur ser jag vilken disk partitionen jobbar mot? vill ha ubuntu på min raptor + viktiga program och resten på min stora slödisk.