Permalänk
Avstängd

Linux - fel på foldingen?

Har foldat på ett protein i cirka 9,5 timme - men fick bara 3000 steps. Började på ett nytt protein efter jag uppgraderade Linux Ubuntu 8.04 till 8.10 och funderar om det kan bero på det? Eller kan det vara ett protein som kräver mycket beräkningar? 3000 steps har tidigare bara tagit några minuter.

Edit: VLC hade hängt sig, låg i bakgrunden och snodde all cpu-kraft.

Visa signatur

Knowledge is not achieved until shared.

Permalänk
Medlem

Folding verkar funka dåligt i ubuntu 8.10. Det gjorde det för mig iaf. Har hört det från andra också.

Visa signatur

AMD Ryzen 5 3600 | 32GiB DDR4-3466 | MSI B450-A Pro Max AGESA 1.0.0.6 | Sapphire RX 480 Nitro+ OC 8GiB | Crucial MX500 500GB | WD10EADS 1TB | WD10EAVS 1TB | Samsung 850 EVO 500GB | Scythe Kamariki 4 450W

Permalänk
Medlem

Hm när det gäller Linux folding så vad jag vet så är det enda kravet 64 bitars prolle

Visa signatur

//Axeteg

Permalänk
Avstängd
Citat:

Ursprungligen inskrivet av m3tr0
Folding verkar funka dåligt i ubuntu 8.10. Det gjorde det för mig iaf. Har hört det från andra också.

Fungerar perfekt, även en liten extra push än tidigare.

Visa signatur

Knowledge is not achieved until shared.

Permalänk
Medlem

Jag kör 64bitars Ubuntu 8.10 på en AMD Quad 2.3Ghz.

Det har fungerat utmärkt i en vecka nu, en smp-WU om dygnet ungefär, utan några problem alls.

Visa signatur

Foldning: 2xGTX285, 1xGSO9600, 2 UniCore clienter.

Permalänk
Medlem
Citat:

Ursprungligen inskrivet av Gnofnyr
Jag kör 64bitars Ubuntu 8.10 på en AMD Quad 2.3Ghz.

Det har fungerat utmärkt i en vecka nu, en smp-WU om dygnet ungefär, utan några problem alls.

Bara en WU om dan låter lite. Jag gjorde 2 st SMP-WU och lite till på ett dygn ungefär fast då använde jag Notfred's CD (64-bit linux det också förstås).

Visa signatur

AMD Ryzen 5 3600 | 32GiB DDR4-3466 | MSI B450-A Pro Max AGESA 1.0.0.6 | Sapphire RX 480 Nitro+ OC 8GiB | Crucial MX500 500GB | WD10EADS 1TB | WD10EAVS 1TB | Samsung 850 EVO 500GB | Scythe Kamariki 4 450W

Permalänk
Medlem

Foldar just nu sedan några minuter på min debian burk har två slöa 3ghz processorer i den... hur kikar jag på mina framsteg?

Visa signatur

Fractal Define R2, Fractal Newton R2 800W, INTEL CORE I7 980, 12GB Corsair pc 12800. Ny gpu och skärm skall inhandlas

Permalänk
Medlem
Citat:

Ursprungligen inskrivet av lhffan
Foldar just nu sedan några minuter på min debian burk har två slöa 3ghz processorer i den... hur kikar jag på mina framsteg?

FahMon, kolla min sign.

Permalänk
Medlem

Om man skall kolla från sin win7 installation hur foldingen går på sin debian burk då?

Visa signatur

Fractal Define R2, Fractal Newton R2 800W, INTEL CORE I7 980, 12GB Corsair pc 12800. Ny gpu och skärm skall inhandlas

Permalänk
Medlem
Citat:

Ursprungligen inskrivet av lhffan
Om man skall kolla från sin win7 installation hur foldingen går på sin debian burk då?

Minns inte riktigt hur jag gjorde när jag hade min stora folding-farm igång en gång i tiden. Men jag gissar på att jag använde mig av SSH-tunnlar för att kunna läsa av folding-mapparna från de andra maskinerna.

Permalänk
Medlem
Citat:

Ursprungligen inskrivet av lhffan
Om man skall kolla från sin win7 installation hur foldingen går på sin debian burk då?

Jag delade ut mappen i linux bara och sedan pekade till den nätverksmappen i FaHmon

Visa signatur

Nyfikenhet = Kunskapens Fader
Repetition = Kunskapen Moder

Permalänk
Medlem

Ska du bara folda SMP ska du använda 8.04, eller 9.04/9.10, 8.10 är inte rekommenderad om du ska få ut max PPD.
Ska du dessutom folda GPU(s) så är det 8.04 eller 9.04 som gäller. (om du kör "rent" linux. Alltså inte relevant om du kör vmware el.dyl.)

9.10 sänker varje GPU med ungefär 40% om du samtidigt SMP-foldar. (egna mätningar)
Skulle du mot förmodan vilja folda både SMP och GPU(s), så får du dedikera en CPU-kärna åt varje GPU i ditt system, och köra SMP på resterande CPU-kärnor, då kan du undkomma problemet.
8.10 är ej rekommenderad sedan tidigare.

Ovanstående gäller Ubuntu-versioner.

Visa signatur

WS: Asus P8Z77-I Deluxe mITX | Intel 3770K@4.6 | NH-U12P | Asus 780 GTX | Corsair 2x8GB 1600Mhz CL9 | Samsung 840 512GB | Ubuntu 16.04.3 x86_64 | Corsair AX750 | 2x Dell U2412M | Puppe.se | NAS: i7 860, 16GB DDR3, GA-P55M-UD4, FD Define R3, 8x2TB Samsung F4EG, Serveraid M1015, EVGA 750W G2 PSU, FreeBSD x64