Du ska alltså ta bort Windows och istället lägga in Ubuntu?
Ubuntu kör inte med bokstavsbeteckningar för hårddiskar utan man monterar in hårddiskutrymme i filsystemträdet. Du behöver ledigt hårddiskutrymme som du kan partitionera upp för ubuntu. Om du tar bort din gamla C-partition när du installerar ubuntu så får du ledigt utrymme, om det nu är så du vill göra.
I och för sig kan det ändå vara vettigt att tillfälligt koppla ur de hårddiskar du inte vill installera på för att minimera risken för misstag. Man behöver inte ta ur dem, räcker koppla ur strömkabeln till dem (alternativt SATA-kabeln).