Du kan välja Installera nu istället för Reparera och sedan göra en uppgradering av den gamla installationen med installationsfilerna från USB minnet, sedan får vi hoppas att filerna som du vill spara finns kvar efter uppgraderingen och att datorn fungerar normalt.
Edit: Om du har tagit bort ei.cfg filen i mappen sources så bör du kunna välja Home Premium efter du har valt Installera nu.
Edit 2: Även jag har Windows 7 Home Premium x64 Svenska med SP1 och använder Windows 7 Professional x64 Svenska SP1 installations filer (X17-59273.iso) på ett USB minne och har tagit bort ei.cfg filen i mappen sources.
Jag lyckades reparera ett start problem med Windows 7 Home Premium som jag av någon konstig anledning själv orsakade nu i natt när jag testade om allt fungerar enligt vad jag har skrivit i denna tråd, jag var tvungen att köra Startreparation 2 gånger för att datorn skulle boota upp Windows igen.
Så för mig fungerar det att boota USB minnet och välja Reparera datorn istället för Installera nu och sedan köra en Startreparation och jag behövde inte välja Home Premium innan Startreparationen.
Edit 3: Om du har flera hårddiskar inkopplad i datorn så rekommenderar jag att du kopplar bort SATA kablarna till dom innan du försöker med startreparation eller uppgradering för att undvika eventuella problem.