"Yes" betyder att OS'et tar hand om resurserna, "No" betyder att BIOS gör det.
Det finns såklart begränsningar.
Du har ju t.ex. oftast ett "IRQ sharing table" som visar vilka enheter som delar IRQ banor med varandra.
Standard är att AGP delar med PCI slot 1, PCI slot 2 är ensam, etc.
Dessa slots kommer att dela IRQ's oavsett om du sätter PnP OS eller inte.