Fel på krypterad partition

Har en partition som är krypterad med hjälp av programmet truecrypt. Har under dagen ändrat lite i partitionstabellen och skapat nya partitioner mm eftersom jag har installerat dualboot. Har inte ändrat något på den krypterade partitionen. Nu när jag bootade windows och monterade den krypterade disken frågar windows mig om jag vill formatera den. Vad kan ha hänt? Har kollat disken med chkdsk men den verkar inte hitta några fel.