Update för eventuellt framtida referens:
När jag i princip hade gett upp hittade jag en forumtråd på annat håll med snarlikt problem. Och det ska erkännas att jag missat/glömt information och kronologisk ordning på vissa saker i min felsökning och problemframställan.
Problemet var den nya riserkabeln som skickades ut efter servicebulletin. Vid närmare eftertanke bytte jag först ut de skruvar som skickades ut och bytte inte riserkabel förrän i samband med kylarbytet. Såhär i efterhand borde jag såklart tänkt på detta direkt när det strulade men kunkskaps- och tidsbrist just då gjorde att det glömdes bort.
Vad jag förstår det som så ska den nya riserkabel som skickats ut stödja gen4 och tolkas också så av BIOS i auto. Efter att ha ändrat till gen3 funkar allt klockrent. Så efter felsökning på över 20 timmar var det inte svårare än så...
Tur man lärt sig en massa under tiden