Om du hade den gamla systemhårddisken inkopplad vid installationen av operativsystemet så ligger troligen bootfilerna för SSDn på den gamla hårddisken, om du bara vill ta bort boot alternativen vid start av datorn så kan man öppna msconfig och ta bort det inte aktuella operativsystemet, men om du vill radera den reserverade partitionen så måste du först fixa nya boot filer på din SSD med den gamla HDDn bortkopplad.
Du kan testa använda verktyget Bootrec.exe för att fixa nya boot filer på SSDn http://support.microsoft.com/kb/927392/sv
Jag hade valt att koppla bort SATA kabeln till gamla HDDn och sedan startat en ny Windows 7 installation genom ta bort allt som finns på SSDn så att hela utrymmet blir "Inte allokerat" och installerat Windows på detta utrymme, när den nya installationen är helt klar och allting fungerar bra så kan du stänga av datorn och koppla tillbaka SATA kabeln till HDDn. när du sedan startar datorn gå direkt till BIOS/UEFI och kontrollera att SSDn är första boot enhet.
Edit: Glöm inte att AHCI skall vara aktiverat i BIOS innan installationen av Windows på SSDn.