Tommy Crea som är forskare jobbar med att försöka bota cancer. Hans fru Isabel har en cancertumör i huvet vilket gör att Tommy desperat försöker finna ett botemedel för att rädda henne. Trots att de på hans laboratorie verkar ha hittat något som kan stoppa åldrande vill han fokusera helt på att bota cancer istället.
Isabel som insett och accepterat sin död försöker få Tommy att göra detsamma, försöker få honom att förstå att döden är en del av livet. Hennes sista önskan är att han ska avsluta hennes bok, men Tommy vägrar acceptera att hon ska dö och ignorerar hennes önskan.
Precis innan de upptäcker att ämnet som verkade stoppa åldrandet även botade cancer dör Isabel. På sjukhuset ser Tommy en jättegammal man ligga på sin dödsbädd, men trots sin ålder har mannen fortfarande kvar sin vigselring och Tommy får enorma skuldkänslor som kommer att jaga honom i lång tid.
När det under begravningen påstås att "Isabel iallafall accepterade sin död och inte var rädd" får Tommy nog och bestämmer sig för att bota "sjukdomen" döden.
På sjukhuset hade Isabel, strax innan hon dog, berättat för Tommy om hur det i moseboken beskrivs hur en död kunde växa in i ett träd som planterats på den dödes grav. Därför planterar Tommy ett träd över Isabels grav som Isabel sedan växer in i.
Fortsatt forskning leder till att man stoppar åldrande och eftersom Tommy insett att även trädet som Isabel växt in i kommer dö bestämmer han sig för att göra som Mayafolket Isabel berättade om för honom när det kollade på skärnorna i snön. Han väntar i hundratals/tusentals år tills tekniken är inne och tar med sig trädet(isabel) i sitt rymdskepp(bubblan) till Xibalba där det två enligt sägnen skall återfödas.
Men precis som tidigare dör trädet precis innan han är framme. Tommy misslyckas ännu en gång. Jagad av hallucinationer och minnen av Isabel inser han tillsut det han borde insett för länge länge sedan; att döden är en del av livet. Han bestämmer sig för att tillslut uppfylla Isabels önskan och avslutar boken "The Fountain" i sitt huvud(dom zoomar in hans panna). Tommy accepterar döden så bra att han till och med avslutar boken med att låta The Conquistador dö för att ge liv åt annat.
"Death as an act of creation"