Nu är det löst!
Det fanns tydligen två inställningar för PCIe och jag hade bara pillat på den ena, vilken inte gjorde någon skillnad.
Advanced/PCH Configuration/PCI Express Configuration/PCIe Speed -->Gen2
Advanced/System Agent Configuration/Graphics Configuration/NB PCIe Configuration/PCIEx16_1 Link Speed -->Gen2
Nu visar GPU-Z PCIe 2.0 och grafikkortet fungerar perf med risern!
Om någon har en förklaring på vad den övre inställningen gör så vore det intressant att veta.
Vad jag har förstått så blir det för hög latens i en ~20 cm riser vilket innebär att PCIe 3.0 blir för snabbt?
Troligtvis därför jag inte heller hittat någon riser som klarar 3.0 då det beror på för långt avstånd mellan moderkort och grafikkort.
J*klar vad jag har svurit åt det här problemet haha