Dist. tips till en atom ?

Tänk så här: Linux-kärnan i sig är redan resurssnål. Det som drar resurser, är allt extra som distributionerna knölar in i maskinen.
För en server behövs ingen grafisk miljö, såvida man inte har speciella behov.
För en server rekommenderar jag en slimmad distribution som inte inkluderar någon grafisk miljö "per default".
Till exempel Arch Linux eller Gentoo. Dessa två ger ett grundläggande system utan en massa onödigt lull-lull som snabbt kan anpassas med ett fåtal kommandon.

Nu kanske Gentoo blir lite av ett för stort projekt att knåpa ihop för atom-processor då det mesta behöver kompileras från källkod, och behöver därmed processorkapacitet för att installationen inte skall ta två och en halv evighet.

Då faller valet över till Arch Linux.

Arch Linux -> LAMP tjänsterna -> Klart.
Där har du en komplett webbserver med goda anpassningsmöjligheter.
Läs vidare:
Installera Grunden till Arch Linux: https://wiki.archlinux.org/index.php/Install
Installera och konfigurera LAMP: https://wiki.archlinux.org/index.php/LAMP

Annars så finns ju alltid debian.
Väldigt resurssnålt, och stabil linuxdist.
Passar utmärkt till serverändamål.

http://www.debian.org

Du kan kika på howto forge.
Där finns väldigt bra guider, på hur du sätter upp en lamp stack i debian.
(lamp = linux,apache,mysql,php)

http://www.howtoforge.com

Vill du köra en mer lättviktig webserver än apache, så finns bra guider för lighttpd och nginx med.

Arch inte för server?
Nu tror jag du fått det om bakfoten.
...och Arch är inte så extremt "Bleeding Edge". Jag skulle säga att Arch är högst välbalanserad kombination av "Stable" och "rolling bleeding edge".

Arch är till för alla typer av system då det är en högst anpassningsbart system. Arch börjar med en högst slimmad grund som till och med fungerar ypperligt för inbäddade resursbegränsade system. Därefter bygger man på det man vill ha. Arch och dess paketsystem (pacman) gör denna anpassning högst enkel utan att tumma för mycket på anpassningsbarheten.
Allt onödigt "distributions-lull" som de flesta stora distributionerna knölar in, slipper man alltså.

De flesta som inte är insatta i vad Arch är tror att det bara har ett paketsystem. Men i själva verket finns där två system som i grunden använder sig av PKGBUILD-filer. Den ena är Pacman, som är det officiella paketsystemet. Sedan tillkommer AUR (Arch User Repository) som är mer "Bleeding edge" och "Custom" än det officiella.
AUR är inget krav, utan ett frivilligt komplement för de som känner att Arch officiella paket inte duger eller är snabba nog att uppdatera.