Hmm... Jag utgår ifrån att du använder Microsoft Outlook XP (2002). Jag hade ett liknande problem igår som jag löste genom att helt enkelt stänga av programmet och starta det igen!!
Så länge det inte är ett hotmailkonto du har lagt till så kommer alla i samma inbox, jo... Det är förstås såvoda du inte skapar en ny mapp och skapar en regel.