Vad ska man kunna som junior systemutvecklare(.NET)

En del designmönster kan väl vara bra att kunna.
Dock anser jag att det är någonting som det skiljer mycket från jobb till jobb och projekt till projekt, därför är det kanske bättre om du snabbläser lite om olika designmönster, och vid behov så sätter du dig in i enskilda lite djupare.

Generics är superbra att kunna, och det är vad jag anser vara en självklarhet rent kunskapsmässigt. Det är ofta så att man utvecklar utifrån en existerande, mer generell kodbas, så därför är det ju någonting man använder hela tiden.
Det jag skulle vilja tipsa om är LINQ. Det är väldigt lätt att lära sig och det är väldigt användbart också i nästan alla typer av applikationer.

Utöver detta så kan man ju alltid fila sina kunskaper ytterligare, gärna träna det du sedan vill jobba med (ex. ASP om webb). Lycka till!

En sak till jag vill nämna är att du borde skapa ett konto på github där du samlar alla dina hobbyprojekt som du refererar till när du söker jobb. Det är det bästa du kan göra på ditt CV. Projekten behöver inte ens vara relaterade till det som står i jobbeskrivningen, men det ger dem en bra insyn i hur du skriver kod.