Låg PPD

2011-03-01 10:56

Permalänk

Merlinen

Medlem

Plats: Luleå
Registrerad: Jul 2002

●

Låg PPD

Tycker jag har lite låg PPD om man kollar "Points 24hr Avg".

Just nu foldar jag med dessa 24/7 och dom har rullat på allihop sen jag började.

3st HP Z600 -> Intel Xeon 5630 dessa har jag kollat upp och dom ligger på stabila 11 000 ppd vardera per dag.
2st HP Elite 8100 -> Intel i5 650
1st i7 920@4,2Ghz

Och jag ligger och pendlar mellan 38-44k ppd i genomsnitt per dag.

Är bara på i7'n som jag kör bigadv så jag tycker jag ligger lågt i ppd per dag

Borde ju ligga runt 55 000 - 60 000 eller ?

Visa signatur

Rapportera Redigera

Citera flera Citera

2011-03-01 18:01

Permalänk

era909

Medlem ★

Plats: Örebro
Registrerad: Jan 2010

●

Skrivet av Merlinen:

Tycker jag har lite låg PPD om man kollar "Points 24hr Avg".

Just nu foldar jag med dessa 24/7 och dom har rullat på allihop sen jag började.

3st HP Z600 -> Intel Xeon 5630 dessa har jag kollat upp och dom ligger på stabila 11 000 ppd vardera per dag.
2st HP Elite 8100 -> Intel i5 650
1st i7 920@4,2Ghz

Och jag ligger och pendlar mellan 38-44k ppd i genomsnitt per dag.

Är bara på i7'n som jag kör bigadv så jag tycker jag ligger lågt i ppd per dag

Borde ju ligga runt 55 000 - 60 000 eller ?

Gå till inlägget

Kontrollera så du inte glömt lägga till din passkey på någon av dina SMP-klienter. Det skulle isf betyda att du inte får någon bonus för de WU som görs på den klienten.

Rapportera Redigera

Citera flera Citera

2011-03-01 18:09

Permalänk

Merlinen

Medlem

Plats: Luleå
Registrerad: Jul 2002

●

Skrivet av era909:

Kontrollera så du inte glömt lägga till din passkey på någon av dina SMP-klienter. Det skulle isf betyda att du inte får någon bonus för de WU som görs på den klienten.

Gå till inlägget

Kollat det, alla har rätt passkey :/

Visa signatur

Rapportera Redigera

Citera flera Citera

2011-03-01 18:57

Permalänk

era909

Medlem ★

Plats: Örebro
Registrerad: Jan 2010

●

Skrivet av Merlinen:

Kollat det, alla har rätt passkey :/

Gå till inlägget

Enligt vad jag kan se från din stats-sida på EOC så har du bara lämnat in en enda färdig BIGADV WU hittills. Det skulle ju kunna förklara varför din PPD är så låg - det är bara dina andra klienter som producerar resultat. I så fall verkar det stämma rätt bra med de siffror du nämner.

Kolla logfilen till din bigadv-klient och se om den rapporterar några problem. Kan vara instabil överklockning eller annat som gör att den inte klarar av att slutföra en WU.

Rapportera Redigera

Citera flera Citera

2011-03-01 22:40

Permalänk

Merlinen

Medlem

Plats: Luleå
Registrerad: Jul 2002

●

Hmm här är en bit utav loggen efter en värdig WU.

----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------

[19:36:21] Completed 499300 out of 499375 steps (99%)
[19:36:26] Saving result file logfile_01.txt
[19:36:26] Saving result file checkpt
[19:36:26] Saving result file checkpt.crc
[19:36:26] Saving result file log.txt
[19:36:29] Saving result file protomol.conf
[19:36:29] Saving result file ww.7691.pos
[19:36:29] Saving result file ww.7691.vel
[19:36:29] Saving result file ww.dcd
[19:36:29] Folding@home Core Shutdown: FINISHED_UNIT
[19:36:29] *********************** Log Started 01/Mar/2011 19:36:29 ***********************
[19:36:29] ************************** ProtoMol Folding@Home Core **************************
[19:36:29] Version: 25
[19:36:29] Type: 180
[19:36:29] Core: ProtoMol
[19:36:29] Website: http://folding.stanford.edu/
[19:36:29] Copyright: (c) 2009 Stanford University
[19:36:29] Author: Joseph Coffland <joseph@cauldrondevelopment.com>
[19:36:29] Args: -dir work/ -suffix 01 -nice 19 -checkpoint 15 -notermcheck -lifeline
[19:36:29] 4484 -version 630
[19:36:29] ************************************ Build *************************************
[19:36:29] Date: May 18 2010
[19:36:29] Time: 23:43:52
[19:36:29] Revision: 1819
[19:36:29] Compiler: Intel(R) C++ MSVC 1500 mode 1110
[19:36:29] Options: /TP /nologo /EHsc /wd4297 /wd4103 /wd1786 /arch:IA32 /Ox
[19:36:29] /QaxSSE2,SSE3,SSSE3,SSE4.1,SSE4.2 /Qrestrict /MT
[19:36:29] Defines: _CRT_SECURE_NO_WARNINGS NDEBUG HAVE_GEEKINFO BOOST_ALL_NO_LIB
[19:36:29] XML_STATIC HAVE_EXPAT HAVE_OPENSSL HAVE_LIBFAH HAVE_SIMTK_LAPACK
[19:36:29] Platform: Windows XP
[19:36:29] Bits: 32
[19:36:29] Mode: Release
[19:36:29] ************************************ System ************************************
[19:36:29] OS: Microsoft Windows 7 Professional
[19:36:29] CPU: Intel(R) Core(TM) i7 CPU 920 @ 2.67GHz
[19:36:29] CPU ID: GenuineIntel Family 6 Model 26 Stepping 5
[19:36:29] CPUs: 16 Logical, 1 Physical
[19:36:29] Memory: 5.99 GB
[19:36:29] Threads: Windows
[19:36:29] ********************************************************************************
[19:36:29] ERROR: 98: Failed to change directory to 'work//01'
[19:36:29] ERROR: caused by: 0: chdir() failed: No such file or directory
[19:36:29] Folding@home Core Shutdown: CORE_RESTART
[19:36:33] CoreStatus = 64 (100)
[19:36:33] Sending work to server
[19:36:33] Project: 10024 (Run 285, Clone 0, Gen 86)
[19:36:33] - Read packet limit of 540015616... Set to 524286976.

[19:36:33] + Attempting to send results [March 1 19:36:33 UTC]
[19:37:16] + Results successfully sent
[19:37:16] Thank you for your contribution to Folding@Home.
[19:37:16] + Number of Units Completed: 45

-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------

Där ser man att den tycker att den gjort 45 Units men också att den har svårt att skriva eller hitta någon katalog.

Visa signatur

Rapportera Redigera

Citera flera Citera

2011-03-01 23:00

Permalänk

era909

Medlem ★

Plats: Örebro
Registrerad: Jan 2010

●

Hmmz.. det där ser ju skumt ut. Kör du med -verbosity 9 för att få max info i loggen?

Så här ser det ut för mig när en WU är klar.

[05:56:35] Completed 247500 out of 250000 steps (99%)
[06:30:45] Completed 250000 out of 250000 steps (100%)
[06:30:58] DynamicWrapper: Finished Work Unit: sleep=10000
[06:31:08]
[06:31:08] Finished Work Unit:
[06:31:08] - Reading up to 52713120 from "work/wudata_03.trr": Read 52713120
[06:31:09] trr file hash check passed.
[06:31:09] - Reading up to 47104844 from "work/wudata_03.xtc": Read 47104844
[06:31:09] xtc file hash check passed.
[06:31:09] edr file hash check passed.
[06:31:09] logfile size: 263782
[06:31:09] Leaving Run
[06:31:10] - Writing 100249686 bytes of core data to disk...
[06:31:52] Done: 100249174 -> 96469896 (compressed to 10.5 percent)
[06:31:53] ... Done.
[06:32:20] - Shutting down core
[06:32:20]
[06:32:20] Folding@home Core Shutdown: FINISHED_UNIT
[06:32:24] CoreStatus = 64 (100)
[06:32:24] Unit 3 finished with 57 percent of time to deadline remaining.
[06:32:24] Updated performance fraction: 0.548980
[06:32:24] Sending work to server
[06:32:24] Project: 6901 (Run 22, Clone 13, Gen 0)

[06:32:24] + Attempting to send results [March 1 06:32:24 UTC]
[06:32:24] - Reading file work/wuresults_03.dat from core
[06:32:25] (Read 96470408 bytes from disk)
[06:32:25] Connecting to http://130.237.232.237:8080/
[06:33:40] Posted data.
[06:33:40] Initial: 0000; - Uploaded at ~1256 kB/s
[06:33:40] - Averaged speed for that direction ~1480 kB/s
[06:33:40] + Results successfully sent
[06:33:40] Thank you for your contribution to Folding@Home.
[06:33:40] + Number of Units Completed: 232

[06:33:49] Trying to send all finished work units
[06:33:49] + No unsent completed units remaining.
[06:33:49] - Preparing to get new work unit...
[06:33:49] Cleaning up work directory
[06:33:56] + Attempting to get work packet
[06:33:56] Passkey found
[06:33:56] - Will indicate memory of 2048 MB
[06:33:56] - Detect CPU. Vendor: GenuineIntel, Family: 6, Model: 10, Stepping: 5
[06:33:56] - Connecting to assignment server
[06:33:56] Connecting to http://assign.stanford.edu:8080/
[06:33:57] Posted data.
[06:33:57] Initial: ED82; - Successful: assigned to (130.237.232.237).
[06:33:57] + News From Folding@Home: Welcome to Folding@Home
[06:33:57] Loaded queue successfully.
[06:33:57] Sent data
[06:33:57] Connecting to http://130.237.232.237:8080/
[06:34:02] Posted data.
[06:34:02] Initial: 0000; - Receiving payload (expected size: 24861135)
[06:34:05] - Downloaded at ~8092 kB/s
[06:34:05] - Averaged speed for that direction ~5509 kB/s
[06:34:05] + Received work.
[06:34:05] Trying to send all finished work units
[06:34:05] + No unsent completed units remaining.
[06:34:05] + Closed connections
[06:34:05]
[06:34:05] + Processing work unit
[06:34:05] Core required: FahCore_a5.exe
[06:34:05] Core found.
[06:34:05] Working on queue slot 04 [March 1 06:34:05 UTC]
[06:34:05] + Working ...
[06:34:05] - Calling '.\FahCore_a5.exe -dir work/ -nice 19 -suffix 04 -np 8 -checkpoint 3 -verbose -lifeline 2736 -version 634'

[06:34:05]
[06:34:05] *------------------------------*
[06:34:05] Folding@Home Gromacs SMP Core
[06:34:05] Version 2.27 (Mar 12, 2010)
[06:34:05]
[06:34:05] Preparing to commence simulation
[06:34:05] - Looking at optimizations...
[06:34:05] - Created dyn
[06:34:05] - Files status OK
[06:34:10] - Expanded 24860623 -> 30796292 (decompressed 123.8 percent)
[06:34:10] Called DecompressByteArray: compressed_data_size=24860623 data_size=30796292, decompressed_data_size=30796292 diff=0
[06:34:10] - Digital signature verified
[06:34:10]
[06:34:10] Project: 6901 (Run 8, Clone 16, Gen 1)
[06:34:10]
[06:34:10] Assembly optimizations on if available.
[06:34:10] Entering M.D.
[06:34:16] Mapping NT from 8 to 8
[06:34:19] Completed 0 out of 250000 steps (0%)

Rapportera Redigera

Citera flera Citera

2011-03-02 00:17

Permalänk

Rba

Medlem

Plats: Gävle
Registrerad: Aug 2008

●

Skrivet av Merlinen:

[19:36:29] Core: ProtoMol

Gå till inlägget

Detta är troligtvis en fahcore_b4.exe, kolla aktivitetshanteraren eller i din fahmapp, och det är för singecore, troligen inte vad du vill köra på din i7a.

Kör du möjligtvis -admethods och -bigadv samtidigt? Eller Fah tracker kanske, inte för jag vet varför det skulle krångla då men iaf?

Visa signatur

Rapportera Redigera

Citera flera Citera

2011-03-02 09:45

Permalänk

Merlinen

Medlem

Plats: Luleå
Registrerad: Jul 2002

●

Nix den kör inte med den, den kör alla kärnorna på max, skulle den köra med den så skulle bara 1 kärna jobba eller?

Enda flaggorna som är på är -bigadv och -smp inget annat.

sambt -verbosity 9 är inte på.

Visa signatur

Rapportera Redigera

Citera flera Citera

2011-03-02 11:30

Permalänk

Rba

Medlem

Plats: Gävle
Registrerad: Aug 2008

●

Hm, ok. Skulle rekommendera att ha -verbosity 9 också, så spottar den ut max i loggen. Antar att du har testat att ta bort work-mappen, queue-, fahlog-, och unitinfo-filern?

Visa signatur

Rapportera Redigera

Citera flera Citera

2011-03-02 17:48

Permalänk

Merlinen

Medlem

Plats: Luleå
Registrerad: Jul 2002

●

Skrivet av Rba:

Hm, ok. Skulle rekommendera att ha -verbosity 9 också, så spottar den ut max i loggen. Antar att du har testat att ta bort work-mappen, queue-, fahlog-, och unitinfo-filern?

Gå till inlägget

Nix, har inte testat det.

Är både "FahCore_b4.exe" och "FahCore_a3.exe" som är igång när jag startar klienten, fast det är bara FahCore_a3.exe som tar CPU.

Visa signatur

Rapportera Redigera

Citera flera Citera

2011-03-02 18:00

Permalänk

Rba

Medlem

Plats: Gävle
Registrerad: Aug 2008

●

fahcore_b4 är för singecore. Du borde nog ta och börja om från början, och eftersom du vill folda bigadv måste du ta den nyaste v6.34-klienten, fahcore_a5 heter den nya coren för -bigadv och fås endast via 6.34-klienten. Enklast är ju att börja om med en ren installation.

Visa signatur

Rapportera Redigera

Citera flera Citera

2011-03-03 17:48

Permalänk

Merlinen

Medlem