Det vanliga är väl att de går på låga varv när de inte behövs, sen högre vid behov.
Att köra fläktarna på typ 30% gör väldigt stor skillnad mot att ha dem helt avstängda, och med bra fläktar är det inte säkert man hör skillnad på det ens i ett tyst rum.
Jag ställde in mina fläktkurvor sent igår kväll pga nytt moderkort och testade att stänga av alla vs köra alla på 33-45% (beroende på fläkttyp), det är verkligen gränsfall att jag kunde höra skillnaden, trots att det var så tyst som det blir i rummet.
Edit: Hur har du kopplat fläktarna förresten? Det är väl kanske den viktigaste frågan här. Jag skulle gissa att de har ström till RGB men inte är kopplade till moderkortets fläktheader(s)?