Ipod Shuffle har fem knappar på framsidan av spelaren; play/pause, nästa låt, föregående låt samt höja ljudet och sänka ljudet. På undersidan finns det en knapp för att slå av eller slå på spelaren och en knapp för att välja mellan att slumpa fram låtarna eller att spela upp dem i ordning. Det finns även ett knapplås som aktiveras genom att hålla ner play-knappen i tre sekunder.
Trots att spelaren är väldigt liten är det inga problem att använda knapparna och de ger lagom med motstånd. Även de små knapparna på undersidan är på grund av att de sticker ut enkla att använda. Jämfört med de andra Ipod-spelarna är det trevligt att kunna ändra volymen utan att ta upp spelaren i handen.
Den första generationens Ipod Shuffle levererades med ett halsband och meningen var att man bar den runt halsen. Med den andra generationen Shuffle har Apple helt tänkt om och nu används istället ett clipfäste för att sätta fast spelaren på lämpligt klädesplagg. Med tanke på hur liten spelaren är känns detta som en bättre metod. Man behöver inte heller vara orolig för att spelaren skall hamna i backen om den trots allt tappar fästet, på grund av sin låga vikt räddas spelaren nämligen av hörlurssladden som sitter tillräckligt fast i spelaren för att fungera som en säkerhetslina.
Slutligen kommer vi till det här med (avsaknaden av) skärm. Att hitta en specifik låt är givetvis omöjligt men det är också idén med spelaren. Att spelaren inte har en display ger även en rad fördelar som bättre batteritid, man kan göra den mindre, hållbarheten är bättre och det finns många situationer där en skärm inte är nödvändigt.
