Hjälp med rtorrent+rutorrent

Hej,

Jag har en linuxserver där jag installerat rtorrent. Har sedan med hjälp av rutorrent och apache fått till en lösning där jag kan kommunicera med den vart som helst genom att webbaserat gui. Allting väl, har fungerat hur bra som helst i flera månader, snart ett år. För någon dag sedan så har den dock bestämt sig för att lägga av och jag förstår inte alls varför.

Nu är jag ingen expert på linux så ni får gärna fråga om ni behöver mer information än jag kan ge. Kör Ubuntu 11.04.
Loggen i rutorrent säger "[26.03.2012 11:49:56] The request to rTorrent has timed out." och loopar det meddelandet hela tiden. Har försökt att ändra timeout i rutorrent men det gjorde ingen skiillnad. En annan sak som uppstår i rutorrent är om jag pausar min torrent och laddar om sidan så tar den en jäkla lång tid att dyka upp igen av någon anledning. Den torrent jag lägger in laddar dock aldrig ner.

Senaste loggfilen i apache säger:

[Sun Mar 25 08:53:10 2012] [notice] Digest: generating secret for digest authentication ...
[Sun Mar 25 08:53:10 2012] [notice] Digest: done
[Sun Mar 25 08:53:10 2012] [warn] RSA server certificate is a CA certificate (BasicConstraints: CA == TRUE !?)
[Sun Mar 25 08:53:10 2012] [warn] RSA server certificate CommonName (CN) `inferno' does NOT match server name!?
[Sun Mar 25 08:53:10 2012] [warn] RSA server certificate is a CA certificate (BasicConstraints: CA == TRUE !?)
[Sun Mar 25 08:53:10 2012] [warn] RSA server certificate CommonName (CN) `inferno' does NOT match server name!?
[Sun Mar 25 08:53:10 2012] [notice] Apache/2.2.17 (Ubuntu) PHP/5.3.5-1ubuntu7.7 with Suhosin-Patch mod_scgi/1.13 mod_ssl/2.2.17 OpenSSL/0.9.8o configured -- resuming normal operations
[Sun Mar 25 12:16:31 2012] [error] [client 192.168.1.103] File does not exist: /var/www/favicon.ico
[Mon Mar 26 05:25:03 2012] [error] [client 109.123.122.114] File does not exist: /var/www/vtigercrm
[Mon Mar 26 11:38:48 2012] [error] [client 192.168.1.103] Script timed out before returning headers: RPC2, referer: http://192.168.1.100/rutorrent/
[Mon Mar 26 12:00:00 2012] [error] [client 192.168.1.103] Script timed out before returning headers: RPC2, referer: http://192.168.1.100/rutorrent/

Har dock inte hittat någon log för rtorrent så om ni kan peka mig i rätt riktning så kan jag även lägga in den om så önskas.
I alla fall så står servern på dygnet runt och då jag märkte att jag hade problem så hade ingen omstart eller liknande gjorts. Det bara "uppstod".
Jag kör också en instans av cacti och den fungerar hur bra som helst.

Jag använder inte magnet links helt enkelt. Måste kunna kopiera länken för att sedan klistra in den i rutorrent. Med magnet links så fungerar det inte så det är inte så mycket jag kan göra i dagsläget. Försökt hitta en lösning men inte funnit något än så länge.
Om jag nu måste byta klient så måste det nog också bli ändringar i hur jag sköter mitt webbaserade gränssnitt, vilket känns mindre roligt.

rtorrent är igång. Glömde kanske nämna det men jag kan gå in på servern och där manuellt lägga in torrent-filen. Den verkar dock inte komma igång alls då det står att den inte får någon kontakt med trackern alls. Har provat samma torrent på en annan dator utan några som helst problem.

Nu verkar jag dock inte kunna lägga till en torrent manuellt, så allt pekar mot att det är något vajsing med rtorrent helt enkelt. Får väl lov att ominstallera den. Angående qbittorrent är så det inget alternativt då jag inte har något GUI.

EDIT:
rtorrent är också igång. Har provat att boota om servern samt startat upp det igen. När rtorrent är nere så får inte rutorrent kontakt samt genererar en felkod, vilket inte är fallet just nu.