Coronaviruset (SARS-CoV-2)

Det är ungefär som jordbävningar. Du vet att de händer med en viss frekvens över en viss tid, men kan ändå inte förutsäga när de sker. Även pandemier har en oviss, statistiskt labil framtid. Man kan heller inte förutsäga vilka effekter de få framöver, varken jordbävningar eller pandemier.

Däremot kan man se mönster bakåt i tiden och se vilka trender som fanns.

Jag är med på att det inte går att förutspå när vi kommer få en pandemi, men hur kopplar du det till det vi diskuterade innan? Det är oklart för mig varför det betyder att det går att jämföra olika länder genom att kolla på effekten av en restriktion, utan att vi vet hur restriktionen har påverkat folkets beteende i praktiken.

Vi kan studera olika områden hur ofta de har jordbävningar. Jämför Italien och Sverige. Det är en enorm skillnad i antal jordbävningar. Vi kan se att det finns förklaringar till skillnaderna, t.ex. närheten till en subduktionszon.

På samma sätt kan du bedöma skillnader mellan länder. Vi vet att Italien fick en tidig dos av covid-19-fall via de som besökt Wuhan. Varför fick inte Sverige eller Island eller Finland lika många direkt? Nja, det var väl för att inte lika många därifrån hade besökt Wuhan.

Det här vet vi inte heller om det är därför. Det finns säkert en del regioner i världen som har fått lika många eller fler resenärer från Wuhan under samma period utan att det orsakade samma situation som i Italien.

Har du rimlig anledning att tro att det är fallet?

Då har du tur, bor i en förort norr om Stockholm och beställer hem nästan allt. Kan bli riktigt trångt i affären och få använder munskydd. Det är bara om jag behöver nå mejeri produkter jag går ner och då får man hänga på låset eller se till att va där precis innan stängning.

...precis. Eller att det ens var Wuhan som var ursprunget då det påvisats att det funnits i bl.a. Italien sedan september 2019 där ca 11% av 900 asymptomatiska i undersökningen hade antikroppar.
https://journals.sagepub.com/doi/full/10.1177/030089162097475...

Wow! Det här måste jag läsa!

EDIT: Hittade även den här:

Carrat, F., Figoni, J., Henny, J., Desenclos, J. C., Kab, S., de Lamballerie, X., & Zins, M. (2021). Evidence of early circulation of SARS-CoV-2 in France: findings from the population-based “CONSTANCES” cohort. European journal of epidemiology, 1-4. (https://link.springer.com/content/pdf/10.1007/s10654-020-0071...)

Mysteriet tätnar.

Du lär maila Twitler aka Trump och föreslå ett namnbyte från China Virus till French Fries Virus. Fast allt är ju bara FAKE NEWS ivfsh!

// Freedom Fries Rulez -despite those cheesy frogeaters that help us win the American Revolution

Hittade man inte en kvinna i dalarna som varit sjuk i december men man visste inte vad det var då och sedan när man kollade hennes blodprover typ ett halvår senare så kunde man konstatera att hon hade haft covid? Hon hade inte varit utomlands heller om jag minns rätt.

Det blev ganska stora rubriker av det. Se Boms post.

Just det, tack!

Jo men de har både studerat röntgenbilder och har antikroppstest. Självklart finns ju alltid möjligheten att det kunnat vara något annat men läkaren verkade ju tycka att det var sannolikt att kvinnan haft det redan då.

Fräckt. Men vad är då kopplingen till myrkottar och fladdermöss man tidigare basunerat ut? Eller har det bara varit antaganden, baserat på hur coronavirus uppträtt tidigare? Jag tänker att myrkottar inte är jättevanliga i Italien, även om fladdermöss såklart finns.

EDIT:
Jag antar att det fortfarande är möjligt att ursprunget fortfarande är detsamma, men att tidshorisonten är helt annorlunda. Vad är det som säger att den mutation som orsakade det första stora utbrottet vintern 19/20 faktiskt var den första att spridas i nån utsträckning alls?

Ändå SVT, tror att de tog upp det på riks också men med inslaget från SVT Dalarna. Annars undrar jag hur jag har sett det jag bor ju i Stockholm. SR Dalarna rapporterade också om det.

Vad jag kan se är det svårt att säga något om ursprunget i de artiklar jag sett. Myrkottarna kan ha varit en villfarelse, då antalet och formen av mutationerna från xxx till CoV-Sars-2 verkar ha varit både många och udda. Nej, jag har ingen källa här och nu.

Men, en djup europeisk spridning betyder kanske inte så mycket heller, egentligen. Det kan vara så att den variant vi hade under 2019 var en "mild" variant som inte gav de hårda symptom med dödsfall som började synas på allvar först under december 2019, och då i Wuhan.

Här lär det bli relevant om man skall tolka ett C till ett G, eller ett A till ett T (eller tvärtom) som i ett senare skede i virusets förändring över tid kanske går åter. Det finns för många artiklar om ämnet för att man skall få en överblick. Det används absolut datorer här, redan. Säkert grafikkort också, då det framstår som en typ av repetitiv beräkning.

Jag tror att även Tegnell har nämnt något om svårigheterna med en gigantisk ström av forskningsartiklar, trots att han har en "stab" som arbetar med att tolka och analysera dem, direkt eller indirekt.

Oavsett det så är tidshorisonterna både intressant och relevanta här. Det som skedde under 2019 är fortfarande lite udda. Men, jag tror att alla saknar relevanta data för att kunna gå vidare på riktigt. Men, ändå lär det ligga cpu:er från både Intel och Amd och tugga på det här.

Så, vi ha redan haft folding@home (https://www.hpcwire.com/off-the-wire/over-4-million-computers...), men jag har inte sett uppföljningar av det. Har någon annan sett en uppdatering?