Olagligt lär det väl knappast vara, såvida det inte är fel på någon lag, vilket iofs händer ofta. Rent moraliskt har du naturligtvis all rätt att köra omkring med en ubåt på internationellt vatten bäst fasen du vill.
Edit: För att vara övertydlig: Dina problem är inte de juridiska, utan de tekniska. Om du klarar av det tekniska så kommer du ha resurserna att skaffa alla erforderliga tillstånd eller makten att helt enkelt skita i dem. Jag förstår inte vad någon myndighet skulle ha att göra med vad du gör på internationellt vatten, så länge du inte sänker fartyg och härjar... Det dummaste du kan göra är att betala pengar för att skaffa tillstånd bara för att upptäcka att de de tekniska eller ekonomiska hindren är för stora. Börja med det ingenjörsmässiga och låt inspirationen flöda. På vägen kommer du få känn för om du eventuell kommer behöva tillstånd eller liknande för något...
Tror dock inte Karlskronas hamn räknas till internationellt vatten inte heller vattnet direkt utanför norra Tyskland.