Rent generellt så är väl nackdelarna att det är väldigt begränsat för utbyggnad (finns oftast plats för 1-2 hårddiskar, 1 agp(eller pci-express), 1 pci, och en cd/dvd). Så vill man kunna stoppa in en massa prylar i datorn så är barebone ett dåligt val. Kan också vara lite problematiskt med kylning = hög ljudnivå på fläktar om man stoppar väldigt extrema grafikkort (om de ens får plats, värstingkorten är nog i många fall lite för stora för att ens få i, dessutom så kanske inte nätdelen pallar det), och/eller om man t ex vill överklocka processorn.
Ska du inte bygga världens extremaste speldator, utan kan nöja dig med lite mer normala grafikprestanda i spel och så, och klarar dig med en optisk enhet (DVD-bärnnare), en hårddisk, en pci-port och att det bara finns plats för två minnesmoduler (vissa kan ju tycka att det är en nackdel). Så kan en barebone nog passa bra för dig.
Funderar själv i exakt samma banor (att skaffa en barebone) och tänker använda min till spel också ibland....