Likt tidigare kort i Pascal-serien är även Geforce GTX 1060 utrustad med turbometoden GPU Boost 3.0. Tekniken baseras på tidigare inkarnationer, men ger nu möjlighet att kontrollera frekvensen för olika lägen av spänningstrappan. En mer detaljerad genomgång finns i recensionen för Nvidia Geforce GTX 1080.
Observera att alla överklockningsresultat ska ses som potential och indikationer, inte fakta. Även om SweClockers ställer jämförelsevis höga krav på stabilitet med tunga tester rullandes under långa perioder kan möjligheterna till frekvensökningar variera stort mellan olika exemplar.
I överklockat läge lyckas Nvidias nykomling GP106 pressas upp till en boost-frekvens på 1 909 MHz, vilket är en jämna 200 MHz över referens. Med hjälp av GPU Boost 3.0 lyckas kortet gå upp ytterligare 116 MHz och stabiliseras på en frekvens runt 2025 MHz. Kortets GDDR5-minnen når en nivå runt 9 408 MHz, cirka 17 procent över referensfrekvensen 8 008 MHz.